cusp :: io :: write_matrix_market_file（）提供訪問沖突異常

Question

我正在嘗試使用CUSP將Matlab的272 x 544雙矩陣讀取為ELLPACK格式的稀疏矩陣。 到目前為止，我唯一能找到的方法是將數據讀入mxArray，將mxArray讀入double *數組（使用mxGetPr（）），然后將值復制到cusp :: array2d。 到達那里后，我需要將array2d寫入.mtx文件，然后將其讀入coo_matrix，最后將其轉換為ell_matrix。 即使對我來說，這聽起來也很愚蠢，但是鑒於CUSP的文檔很少，這是我能想到的最好的。 如果有人推薦一種更好的方法，我將非常感謝。

無論如何，我現在面臨的問題是，在讀取array2d中的數據並嘗試使用cusp :: write_matrix_market_file（）將其寫入.mtx文件后，我收到“未處理的異常：寫入位置訪問沖突”錯誤消息。 我嘗試從array2d中打印一些值，然后再嘗試將它們寫入文件，只是為了確保所有內容都到位並且這些值似乎可以很好地存儲在array2d中。 我也嘗試將類型更改為float，但錯誤仍然存​​在。 這是我完成此任務的代碼：

     #include <thrust/version.h>
     #include <cusp/version.h>
     #include <cusp/ell_matrix.h>
     #include <cusp/print.h>
     #include <cusp/io/matrix_market.h>
     #include <cusp/array2d.h>
     #include <cusp/coo_matrix.h>

     int main(int argc, char** argv)
     {
      const mxArray* mx_g_tra;
      //Reading data from Matlab   
       mx_g_tra = openMatFile2("C:\\out.mat", ndir, "out.tra");
   double* g_tra = mxGetPr(mx_g_tra);
   sizeG_tra=(int)mxGetNumberOfElements(mx_g_tra);
   const mwSize* traDims= mxGetDimensions(mx_g_tra);

      //get matrix dimensions
       tra_W= traDims[0];
   tra_H= traDims[1];
   printf("\nAcquired %d TRA elements as %d x %d from Maltab.\n", sizeG_tra, tra_W, tra_H);
       cusp::array2d<float, cusp::host_memory> TRA(traDims[0], traDims[1]);
       if(g_tra != NULL)
       {
       for(int i=0; i< traDims[0]; i++)
        {
         for(int j=0; j<traDims[1]; j++) 
          {TRA(i,j) = (float)g_tra[i*traDims[1]+j];
           if(TRA(i,j) != 0) printf("\nTRA(%d, %d) = %g", i, j, TRA(i,j));}
        }
       }

 cusp::io::write_matrix_market_file(TRA, "C:\\TRA.mtx"); 

在出現異常時，調用堆棧指向：cusp :: io :: detail :: write_value>，float>（std :: basic_ofstream>＆output = {...}，const float＆value =）行116 + 0x5字節的C ++

編輯：快速更新：我通過修改文件“ matrix_market.inl”擺脫了異常，它們有一個怪異的嵌套循環，該循環通過遍歷矩陣cols然后再次cols將值寫入文件（從不考慮num_rows）顯然，因為我的矩陣是如果不是正方形，則代碼正在嘗試訪問不存在的位置。這是修改后的代碼：

      for(size_t j = 0; j < mtx.num_cols; j++)
       {
    // Modified below: mtx.num_cols --> mtx.num_rows
         for(size_t i = 0; i < mtx.num_rows; i++)
         {
         write_value(output, mtx(i,j));
         output << "\n";
          }
         }

我不確定這從.mtx文件讀取時如何影響不同格式的構造函數

Answer 1

這段代碼為我工作，展示了如何直接從array2d轉換為coo或ell：

編輯：更新的代碼示例以顯示cusp::is_valid_matrix()用法

 #include <stdio.h>
 #include <cusp/verify.h>
 #include <cusp/ell_matrix.h>
 #include <cusp/io/matrix_market.h>
 #include <cusp/array2d.h>
 #include <cusp/coo_matrix.h>

 int main(int argc, char** argv)
 {
  // initial matrix
   cusp::array2d<float, cusp::host_memory> E(4, 3);
   E(0,0) =  1.000e+00; E(0,1) =  0.000e+00; E(0,2) =  0.000e+00;
   E(1,0) =  0.000e+00; E(1,1) =  1.050e+01; E(1,2) =  0.000e+00;
   E(2,0) =  0.000e+00; E(2,1) =  0.000e+00; E(2,2) =  2.500e-01;
   E(3,0) =  0.000e+00; E(3,1) =  2.505e+02; E(3,2) =  0.000e+00;

   cusp::coo_matrix<int, float, cusp::host_memory> coo(E);
   cusp::ell_matrix<int, float, cusp::host_memory> ell(E);
   if (!cusp::is_valid_matrix(coo)) {printf("Invalid COO\n"); return 1;}
   if (!cusp::is_valid_matrix(ell)) {printf("Invalid ELL\n"); return 1;}

   cusp::io::write_matrix_market_file(coo, "COO.mtx");
   cusp::io::write_matrix_market_file(ell, "ELL.mtx");
   return 0;
 }

Answer 2

只要行數大於cols數，就不會有異常，代碼也不會出現問題。 我遇到的問題是因為行數是cols數的一半。 因此，當文件“ matrix_market.inl”中的write_value假定我的矩陣是一個正方形矩陣，並且在兩個循環中僅考慮num_cols時，我得到了錯誤。 實際上，引發異常時的i值為273（我的272 x 544矩陣中不存在的第一行）。 我通過在“ matrix_market.inl”代碼中編輯write_matrix_market_stream來解決此問題，如下所示：

       template <typename Matrix, typename Stream>
       void write_matrix_market_stream(const Matrix& mtx, Stream& output, cusp::array2d_format)
       {
        typedef typename Matrix::value_type ValueType;

        bool is_complex = thrust::detail::is_same<ValueType, cusp::complex<typename                   norm_type<ValueType>::type> >::value;

        if (is_complex)
        output << "%%MatrixMarket matrix array complex general\n";
        else
        output << "%%MatrixMarket matrix array real general\n";

        output << "\t" << mtx.num_rows << "\t" << mtx.num_cols << "\n";

        for(size_t j = 0; j < mtx.num_cols; j++)
        {
         // EDIT needed here
     // Modified below: mtx.num_cols --> mtx.num_rows
        for(size_t i = 0; i < mtx.num_rows; i++)
          {
             write_value(output, mtx(i,j));
            output << "\n";
          }
        }
        }