[英]RODBC connection to Oracle database not working, crashes R
我有許多腳本可以在Windows XP上通過ODBC從Oracle 10g數據庫中獲取數據,這些腳本已經運行了好一陣子。 我最近設置了一個新的Oracle帳戶,以從同一數據庫的另一個架構中提取數據,但是,當我使用該帳戶和不同的架構進行測試時,會得到奇怪的結果,並且有時(完全)可以完全殺死R!
我使用odbcConnect連接到數據庫,並且嘗試了believe相信ows和rows_at_time沒有區別
>imcon<-odbcConnect(sid, uid=uid, pwd=pwd, believeNRows = FALSE, rows_at_time=1)
> odbcGetInfo(imcon)
DBMS_Name DBMS_Ver Driver_ODBC_Ver Data_Source_Name Driver_Name Driver_Ver ODBC_Ver Server_Name
"Oracle" "10.02.0030" "03.51" "SID" "SQORA32.DLL" "09.02.0000" "03.52.0000" "SID"
然后,我嘗試一些查詢(如我所能做到的那樣簡單。此查詢返回零行(此表中有兩行),並且大多數列名都替換為An。
> sqlQuery(imcon, "select * from SCHEMA.USERS;")
[1] PASSWORD USER_DISABLED USE_DOMAIN_AUTHENTICATION ID DESCRIPTION
[6] ADMIN_USER A A.1 A.2 A.3
[11] A.4 A.5 A.6 A.7 A.8
[16] A.9 A.10 A.11 A.12 A.13
[21] A.14 A.15 A.16 A.17 A.18
[26] A.19 A.20 A.21 A.22 A.23
[31] A.24 A.25 A.26 A.27 A.28
[36] A.29 A.30 A.31 A.32 A.33
<0 rows> (or 0-length row.names)
Warning messages:
1: In deparse(., width.cutoff = max(20, width - 10)) :
invalid 'cutoff' for deparse, using default
2: In deparse(., width.cutoff = max(20, width - 10)) :
invalid 'cutoff' for deparse, using default
此方法有效,但返回零行,並且兩個日期列被截斷為L和L.1。
> sqlQuery(imcon, "select ID, DESCRIPTION, NAME, FIRST_NAME, LAST_NAME, DATE_CREATED, DATE_LAST_MODIFIED from SCHEMA.USERS;")
[1] ID DESCRIPTION NAME FIRST_NAME LAST_NAME L L.1
<0 rows> (or 0-length row.names)
這工作正常,並返回數據
> sqlQuery(imcon, "select ID, DESCRIPTION, NAME, FIRST_NAME, LAST_NAME, ADMIN_USER from SCHEMA.USERS;")
ID DESCRIPTION NAME FIRST_NAME LAST_NAME ADMIN_USER
1 1 <NA> SYSTEM <NA> NA TRUE
2 2 Admin user ADMIN Admin NA TRUE
老實說這似乎殺死了R
> sqlQuery(imcon, "select ID, DESCRIPTION, NAME, FIRST_NAME, LAST_NAME, DATE_CREATED from SCHEMA.USERS;")
R死了。 (都在StatEt和RGui中)
所以我的問題
a)有人知道出了什么問題嗎?
b)有人知道我可以采取哪些進一步的步驟來診斷嗎?
經過反復嘗試並試圖簡化我的問題,我注意到SQLPlus的輸出非常奇怪(列標題的下划線非常長)。 這導致我查看SQL Developer中的數據,該數據向我展示了列類(我確信SQLPlus也可以做到這一點)。 看起來大多數文本字段是varchar2(4000)或類似字符,日期字段是帶時區的datestamp。 似乎varchars阻止返回結果,而datestamps完全殺死R。
我修改了查詢,將這些列恢復為正常值,例如,對varchar2使用substr,對日期戳使用to_char;
select substr(t1.STATUS_DETAIL,0,24) as DETAIL,
to_char(t1.DATE_CREATED,'YYYY-MM-DD HH24:MI:SS') AS DCREATED
from SCHEMA.TABLE;
阻止了R崩潰,並返回結果! 我將通過電子郵件將RODBC的軟件包維護者發送給其他人,並將此答案留給其他有此問題的人。
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