如何在R中刪除圖中的頂點？

Question

我正在嘗試使用delete.vertices(graph ,vertex id)刪除圖中的頂點，但是我看到此錯誤： ”Cannot create iterator, Invalid vertex id, Invalid vertex id”

這是我的代碼：

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
delete.vertices(graph,c(717527,61373))

717527和61373是我的頂點數。

這是圖：

我怎樣才能做到這一點？

Answer 1

因為給出的一個頂點不在圖形頂點列表中，所以會出現錯誤。 一個建議嘗試使用igraph函數，一旦您熟悉它們，就將其應用於自定義圖形。 這里有一個示范：

 library(igraph)
 g <- graph.ring(10)
 V(g)
Vertex sequence:
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

現在，我嘗試刪除現有的頂點：

delete.vertices(g, c(2,7,9) )
IGRAPH U--- 7 4 -- Ring graph
+ attr: name (g/c), mutual (g/x), circular (g/x)

對於不存在的錯誤，我得到您的錯誤：

delete.vertices(g, c(20))

Error in delete.vertices(g, c(20)) : 
  At iterators.c:759 : Cannot create iterator, invalid vertex id, Invalid vertex id

Answer 2

您正在使用Igraph嗎？

read.graph函數可能正在以字符串形式讀取頂點ID。 在這種情況下，您可能需要：

delete.vertices(graph,c('717527','61373'))

代替。 同樣，delete.verticies返回一個新的圖形對象。 如果要查看更改后的結果，請確保將結果存儲在圖形中。

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
graph<-delete.vertices(graph,c('717527','61373'))