rJava內存錯誤

Question

我正在使用r的最新版本中的“ dismo”包構建大型物種分布模型。 當我使用代碼處理基本模型時：

me <- maxent(x=train, p=p)

我收到以下錯誤：

> Error in .jcall(mxe, "S", "fit", c("autorun", "-e", afn, "-o", dirout,
> :    java.lang.OutOfMemoryError: unable to create new native thread

在stackoverflow和Internet上有一些關於此錯誤的討論，但似乎都沒有解決如何解決r代碼中的問題。 在這個問題上的任何投入將不勝感激。

以色列干杯

Answer 1

從dismo包中獲取：如果要給MaxEnt（運行它的Java虛擬機）更多的內存，可以在加載dismo庫之前通過運行類似的操作（1 GB）來實現。

options(java.parameters = "-Xmx1g" )

有人報告了在Mac（Apple）計算機上使用此功能時遇到的問題。 具體來說，會出現以下錯誤消息：

Error in .jcall(mxe, "S", "fit", c("autorun", "-e", afn, "-o", dirout, : java.lang.InternalError: Can’t start the AWT because
Java was started on the first thread. Make sure StartOnFirstThread is not specified in your application’s Info.plist or on the command line.

這是Mac上某些Java應用程序的已知問題。 我們知道兩種解決方法：

1）在運行庫rJava之前運行Sys.setenv（NOAWT = TRUE）（如果未加載rJava，這就是dismo的工作）。 2）使用JGR接口（基於Java的R GUI）。 您可以從此處安裝JGR：