用Java存儲多序列文件

Question

我有包含60列和182行的序列文件。 序列是正常的DNA序列，例如A，C，T，G，並且還包含-。 我應該使用什么來存儲和檢索Java？ 具有String類概念或其他東西會有用嗎？

import java.io.*;
public class file 
{
public static void main(String args[]) throws Exception 
{
file fl=new file("FASTA71_5");
FileReader fr=new FileReader(fl);
BufferedReader br=new BufferedReader(fr);
String s;
while((s=br.readLine())!=null) 
{
System.out.println(s);
//System.out.println(s.replace("-","0").replace("G","1")); 
}
//System.out.println(s.replace("-","0").replace("G","1")); } } `enter code here`

Answer 1

使用清單。 在每個列表元素中，您應持有不同的順序。

http://docs.oracle.com/javase/6/docs/api/java/util/ArrayList.html