在 ggplot2 中創建密度直方圖？

Question

我想用ggplot2創建下一個直方圖密度圖。 以“正常”方式（基本包）非常簡單：

set.seed(46)
vector <- rnorm(500)  
breaks <- quantile(vector,seq(0,1,by=0.1))
labels = 1:(length(breaks)-1)
den = density(vector)
hist(df$vector,
     breaks=breaks,
     col=rainbow(length(breaks)),
     probability=TRUE)
lines(den)

到目前為止，我已經使用 ggplot 達到了這一點：

seg <- cut(vector,breaks,
           labels=labels,
           include.lowest = TRUE, right = TRUE)
df = data.frame(vector=vector,seg=seg)

ggplot(df) + 
     geom_histogram(breaks=breaks,
                    aes(x=vector,
                        y=..density..,
                        fill=seg)) + 
     geom_density(aes(x=vector,
                      y=..density..))

但是“y”比例尺有錯誤的維度。 我已經注意到下一次運行正確地獲得了“y”比例。

 ggplot(df) + 
     geom_histogram(breaks=breaks,
                    aes(x=vector,
                    y=..density..,
                    fill=seg)) + 
     geom_density(aes(x=vector,
                      y=..density..))

我就是不明白。 y=..density..在那里，那應該是高度。 那么究竟為什么當我嘗試填充時我的比例會被修改呢？

我確實需要顏色。 我只想要一個直方圖，其中每個塊的中斷和顏色是根據默認的 ggplot 填充顏色定向設置的。

Answer 1

我手動為您的百分位條添加了顏色。 看看這是否適合你。

library(ggplot2)

ggplot(df, aes(x=vector)) +   
   geom_histogram(breaks=breaks,aes(y=..density..),colour="black",fill=c("red","orange","yellow","lightgreen","green","darkgreen","blue","darkblue","purple","pink")) + 
   geom_density(aes(y=..density..)) +
   scale_x_continuous(breaks=c(-3,-2,-1,0,1,2,3)) +
   ylab("Density") + xlab("df$vector") + ggtitle("Histogram of df$vector") +
   theme_bw() + theme(plot.title=element_text(size=20),
                      axis.title.y=element_text(size = 16, vjust=+0.2),
                      axis.title.x=element_text(size = 16, vjust=-0.2),
                      axis.text.y=element_text(size = 14),
                      axis.text.x=element_text(size = 14),
                      panel.grid.major = element_blank(),
                      panel.grid.minor = element_blank())

Answer 2

fill=seg導致分組。 對於seg每個值，您實際上得到了不同的直方圖。 如果你不需要顏色，你可以使用這個：

ggplot(df) + 
  geom_histogram(breaks=breaks,aes(x=vector,y=..density..), position="identity") + 
  geom_density(aes(x=vector,y=..density..))

如果您需要顏色，在 ggplot2 之外計算密度值可能是最簡單的。

Answer 3

或者ggpubr一個選項

library(ggpubr)
gghistogram(df, x = "vector", add = "mean", rug = TRUE, fill = "seg",
   palette = c("#00AFBB", "#E7B800", "#E5A800", "#00BFAB", "#01ADFA", 
   "#00FABA", "#00BEAF", "#01AEBF", "#00EABA", "#00EABB"), add_density = TRUE)

Answer 4

關於解釋y-axis的混淆可能是由於密度繪制而不是計數。 因此， y-axis的值是總樣本的比例，其中條形的總和等於1 。