我需要使用grep -P正則表達式來查找和替換bash腳本中的兩列

Question

如果我有以下列表：

5       chr1
5       chr1
5       chr2
3   chr5

如何使用grep -P切換列1和2的位置？

如果我使用此行：

grep -P "(\w+)\t(\w+)" test.txt

捕獲文本，然后我將如何替換呢？

Answer 1

更好（更容易）在awk中執行此操作：

awk '{a=$1; $1=$2; $2=a}1' OFS='\t' file
chr1    5
chr1    5
chr2    5
chr5    3

更簡單的是：（感謝@BrenoZan）

awk '{print $2"\t"$1}' file

Answer 2

你可以這樣做

grep -oP "\w+" file | rev | paste - - | rev

但是你不會

Answer 3

您可以使用@@ anubhava提及之類的awk （ 我愛awk ）可以正常工作，但是如果您要更改文件內容，請嘗試sed ...

 sed 's/\([^ ]\+\)\s*\(.*\)$/\2\t\1/' -i file

Answer 4

與純殼。

while read -r a b X; do echo $b $a; done < test.txt