如何在R-package中正確包含依賴項？

Question

我現在正在嘗試用幾個小時在R中構建一個包，並且對我進展緩慢有點絕望。 我很快就建立了一個沒有依賴的包，一切正常。 由於幾個帖子中的建議，我使用R Studio，devtools和Roxygen2（在Windows上）。 使用依賴項時，我在檢查時遇到問題（例如使用devtools :: check（））：

檢查R代碼中的依賴關系...注意Imports字段中的命名空間不從以下位置導入：'ggplot2'應使用所有聲明的Imports。 請參閱“Writing R Extensions”手冊“創建R包”一章中有關DESCRIPTION文件的信息。

此外，check（）刪除NAMESPACE中的import(ggplot2)行。 如果我檢查（document = F），它會給出一個未加載的digest包的錯誤錯誤。 我讀了'編寫R擴展' - 1.1.3包依賴關系和Hadley的Wiki關於如何編寫包，但無法解決我的問題。 來自CRAN的其他R軟件包的描述和NAMESPACE文件看起來與我的不同（對我而言）？

問題：我做錯了什么？ 對於這樣一個基本問題感到抱歉，但是在解釋依賴關系之前，我到目前為止看到的大部分分步教程都讓我感到茫然。

到目前為止，我有3個文件：
說明：

Package: test
Type: Package
Title: Foo
Version: 1.0
Date: 2014-03-21
Author: Bar
Maintainer: Foo <bar@mail.com>
Description: Blubb
Imports:
    ggplot2
License: GPL-3

一個NAMESPACE：

export(is.equal.null)
import(ggplot2)

一個R文件：

#' Extension of compare to include NULLs
#'
#' Works as an extension to usual compare
#' Compares two basic objects which in addition to usual compare can be NULL
#' Intuitive output: TRUE if both are equal or NULL resp., FALSE if both are unequal or only one is NULL
#'
#' @param obj1 Basic object like \code{numeric, char, boolean, NULL}
#' @param obj2 Basic object like \code{numeric, char, boolean, NULL}
#' @keywords compare
#' @export
#' @examples
#' is.equal.null(5,5)  # TRUE
#' is.equal.null(5,NULL)  # FALSE
#' is.equal.null(NULL,NULL)  # TRUE
is.equal.null <- function(obj1, obj2) {
  # Small helper function to generalize comparison to comparison of NULL
  # returns TRUE if both are NULL, and FALSE if only one of the objects is NULL
  bool <- obj1==obj2 
  #qplot(obj1)
  if (length(bool)) return(bool)
  if (is.null(obj1) & is.null(obj2)) return(TRUE)
  return(FALSE)
}

Answer 1

您需要在兩個地方聲明導入：

1. DESCRIPTION文件。 你應該有一個類似於的行：

    Imports: ggplot2, pkg1, pkg2 

2. NAMESPACE文件。 在這里，您聲明所需的包

    import(ggplot2) 

   或者避免命名空間沖突

    importFrom(ggplot2, geom_point) 

   您可以使用@import和@importFrom標記獲取roxygen2來維護NAMESPACE文件。

在您的示例中，您的DESCRIPTION文件看起來沒問題，但您尚未向NAMESPACE添加必要的功能。