打開MPI虛擬計時器已過期

Question

我正在Gentoo 3.13上使用Open MPI 1.8，以通過服務器/客戶端概念管理從一個程序到另一個程序的數據傳輸。 服務器和客戶端都通過mpiexec作為單獨的進程啟動。 幾天后（這是很繁重的計算...），有時我會收到錯誤消息

mpiexec noticed that process rank 0 with PID 17213 on node XXX exited on signal 26 (Virtual timer expired).

不幸的是，該錯誤不能以可靠的方式再現，即該錯誤在程序流程中並不總是出現，也不總是出現在同一點。 我在其他計算機上也遇到了此錯誤。 我已經將問題追溯到ITIMER_VIRTUAL ，該問題在到期時會提供SIGVTALRM （請參閱例如http://man7.org/linux/man-pages/man2/setitimer.2.html ）。 在手冊頁的BUGS部分中，它表示

在非常重的負載下，ITIMER_REAL計時器可能會在傳遞來自先前到期的信號之前到期。 在這種情況下，第二個信號將丟失。

我想知道ITIMER_VIRTUAL是否也可以使用類似的方法嗎？ 有沒有人遇到類似的問題並且可以確認錯誤？

我能想到的唯一解決方法是調用setitimer(...)並嘗試自己操作計時器。 但是，我希望有另一種方法，因為我不能總是修改客戶端的源代碼。 有什么建議么？

Answer 1

由於尚未正式回答此問題，因此，我將代表Hristo（@HristoIliev：我希望您可以接受）。 正如我對問題的第一條評論中指出的那樣，Open MPI源代碼中沒有一個提示可能導致虛擬計時器到期。 確實，計時器問題與第三方庫有關，該第三方庫使代碼在無法預測的時間后崩潰（取決於計算機的當前負載）。