![](/img/trans.png)
[英]How to order stacked bar plot x categories by value of one of the fill categories in ggplot2/R
[英]ggplot stacked bar plot with x value and no y/fill value
我正在嘗試以X軸為時間,Y軸為數量,填充顏色為某些特征的方式繪制堆積的條形圖。
我的數據如下所示:
> base
Number Mut Time Percent
1 117 22:A->G 2 81.81
2 13 24:G->A 2 9.09
3 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
4 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
5 32 24:G->A 3 94.11
6 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
7 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
當我使用以下代碼在ggplot中執行堆疊條形圖時:
ggplot(base,aes(x = Time, fill = Mut, y = Percent)) + geom_bar(stat='identity') + theme(legend.key.size = unit(.5, "cm")) + ylab("Number")
我得到一個圖,看起來像這樣:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#0
我的問題是我希望時間= 1和時間= 4的值為零。
類似於以下內容:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#1
有辦法嗎? 現在,我只是在時間1和4中向數據添加了0個值,並將填充特征(Mut)添加為已顯示在數據中的一個:
> base
Reads Mut Time Percent
1 0 22:A->G 1 0.00
2 117 22:A->G 2 81.81
3 13 24:G->A 2 9.09
4 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
5 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
6 32 24:G->A 3 94.11
7 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
8 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
9 0 22:A->G 4 0.00
我的問題是我不想一直搜索數據中已經存在的功能(Mut)。 有沒有一種方法可以讓ggplot自動將time = 1和time = 4的x值放到沒有條形圖的情況下,而不必向數據中添加值? 我一直在搜索數小時,找不到任何答案。
謝謝。
加+ scale_x_discrete(limits = 1:4)
聲明:本站的技術帖子網頁,遵循CC BY-SA 4.0協議,如果您需要轉載,請注明本站網址或者原文地址。任何問題請咨詢:yoyou2525@163.com.