R晶格xyplot與軸的刻度線不匹配網格（不是多圖）

Question

我正在嘗試通過以下代碼生成帶有點陣xyplot的圖：

set.seed(123) #### make it reproducible
df<-data.frame(x=runif(100,1,1e7),y=runif(100,0.01,.08),t=as.factor(sample(1:3,100,replace=T)))
png("xyplot_grid_misaligned.png",800,800)
p<-xyplot(y ~ x,groups=t,data=df,scales=list(x=list(log=10,equispaced.log=F)),auto.key=T,ylim=c(-.01,.1),grid=T)
print(p)
dev.off()

正如預期的那樣，它產生了一個漂亮的情節：

我希望繪圖上的網格與equispaced.log=F生成的刻度線對齊。 xyplot的文檔僅討論了與多個圖有關的grid ，SO和其他站點中的一些其他線程也是如此（實際上，我從另一個站點獲得了grid=T argumment： 在R中使用Lattice圖形 ，甚至在那里您也可以看到（當使用equispaced.log=F時，網格與刻度“對齊”）。

以防萬一有人可能認為這是SO的重復：在網格圖形中將網格線對齊到軸上的線 ，請注意，這里的問題是如何在多圖中對齊網格（並且，當時，該線程還沒有答案）。

使用equispaced.log equispaced.log=F如何使xyplot將網格線“對齊”到x刻度線？ 謝謝！

Answer 1

看來您需要使用自定義面板功能來執行此操作，並使用panel.abline代替panel.grid 。 我能想到的最好的方法是半手動設置刻度線。

library(lattice)
set.seed(123) #### make it reproducible

df<-data.frame(x=runif(100,1,1e7),y=runif(100,0.01,.08),t=as.factor(sample(1:3,100,replace=T)))

# do this one by hand, since you had "equispaced.log=F"
x.at = c(5e3, 10e3, 5e4, 10e4, 5e5, 10e5, 5e6, 10e6)
# but this one is done with `pretty` as usual
y.at = pretty(df$y,4)

png("xyplot_grid_aligned.png",600,600)
p <- xyplot(y ~ x,groups=t,data=df,
            scales=list(x=list(at=x.at,log=10),
                        y=list(at=y.at)),
            auto.key=T,
            ylim=c(-.01,.1),
            panel = function(...) {
                panel.abline(v=log10(x.at),h=y.at,col="lightgrey")
                panel.xyplot(...)
            }
            )
print(p)
dev.off()

Answer 2

如果有幫助，這是一個ggplot解決方案。

ggplot(df, aes(x=x, y=y, color=t)) +
  geom_point(shape=21) + 
  scale_x_log10(breaks=c(5e3, 1e4, 5e4,1e5,5e5,1e6,5e6,1e7)) + 
  theme_bw() +
  theme(panel.grid.minor=element_blank())