python如何等待批處理SGE腳本完成執行？

Question

我有一個問題，我希望你幫我解決。

我在Python工作，我想做以下事情：

• 在服務器上調用SGE批處理腳本
• 看看它是否正常工作
• 做一點事

我現在所做的大概如下：

    import subprocess
    try:
       tmp = subprocess.call(qsub ....)
       if tmp != 0:
           error_handler_1()
       else:
           correct_routine()
    except:
       error_handler_2()

我的問題是，一旦腳本被發送到SGE，我的python腳本會將其解釋為成功並繼續工作，就像它完成一樣。

你有什么建議我怎么能讓python代碼等待SGE腳本的實際處理結果？

啊，順便說一句，我嘗試使用qrsh，但我沒有權限在SGE上使用它

謝謝！

Answer 1

從您的代碼中，您希望程序等待作業完成並返回代碼，對吧？ 如果是這樣，qsub同步選項很可能是你想要的：

http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/htmlman1/qsub.html

Answer 2

更簡單處理的附加答案：使用python drmaa模塊： 鏈接 ，允許使用SGE進行更完整的處理。 在文檔中提供的功能代碼是在這里：只要你把sleeper.sh腳本在同一目錄]請注意到-bn選項需要執行一個腳本.SH，否則它在默認情況下需要一個二進制像解釋這里

import drmaa
import os

def main():
   """Submit a job.
   Note, need file called sleeper.sh in current directory.
   """
   s = drmaa.Session()
   s.initialize()
   print 'Creating job template'
   jt = s.createJobTemplate()
   jt.remoteCommand = os.getcwd()+'/sleeper.sh'
   jt.args = ['42','Simon says:']
   jt.joinFiles=False
   jt.nativeSpecification  ="-m abe -M mymail -q so-el6 -b n"
   jobid = s.runJob(jt)
   print 'Your job has been submitted with id ' + jobid
   retval = s.wait(jobid, drmaa.Session.TIMEOUT_WAIT_FOREVER)
   print('Job: {0} finished with status {1}'.format(retval.jobId, retval.hasExited))
   print 'Cleaning up'
   s.deleteJobTemplate(jt)
   s.exit()

if __name__=='__main__':
    main()