從Neo4j到R控制台作為數據框檢索節點和關系

Question

我已經使用neo4j創建了圖形數據庫，並且我正嘗試從R中檢索一些結果。 但是，相同的“ GeneName”節點具有許多連接，如所附的圖像所示（來自Neo4J）。 因此，是否有可能在R控制台上將GeneName節點的所有連接作為數據框獲取。

更詳細的信息：

我從一個文件中獲取了基因信息，並從另一個文件中考慮了所附屏幕快照中GeneName節點周圍的連接。 我已經寫了密碼來根據所有文件中的通用基因名稱連接各種文件。 例如

文件A（4列多行）

SCA1信息1信息2信息3

文件B（4列多行）

info5 info7 info8 info10 SCA1

現在，我以基於GeneName（SCA1）的方式將兩個文件連接起來，從而編寫了一個密碼查詢

連接兩個文件后的輸出將像

SCA1信息1信息2信息3信息5信息7信息8信息10

因此，在屏幕截圖中，每個GeneName節點都連接到info1 info2 info3 info5 info7 info8 info10

Pavan Kumar Alluri高級項目工程師C-DAC KP印度

！[在此處輸入圖片描述] [1]

Answer 1

您可以嘗試一些方法：

ca1 = getSingleNode(graph, "MATCH (n:GeneName) WHERE n.name = 'CA1' RETURN n")
r = outgoingRels(ca1)

r是關系對象的列表。 您可以在這些節點上使用endNode和startNode。

lapply(r, startNode)
lapply(r, endNode)

要么：

r = getRels(graph, "MATCH (n:GeneName)-[r]->() WHERE n.name = 'CA1' RETURN r")

這還將獲得一個關系對象列表，您可以在該對象上使用apply系列函數以及endNode和startNode。

您還可以使用路徑對象：

query = "
MATCH p = (n:GeneName)-->()
WHERE n.name = 'CA1'
RETURN p
"

p = getPaths(graph, query)
n = lapply(p, nodes)

當然，沒有任何數據可重現您的圖形，我無法確定哪種方法最好。 我強烈建議您閱讀文檔和示例。