為什么 GGally::ggpairs 在 RStudio 中比 base R 慢得多？

Question

根據標題，有誰知道為什么從GGally包渲染ggpairs圖在 RStudio 中比基本 R（或終端）花費的時間要長得多？

例子：

start.time <- Sys.time()
ggpairs(mtcars)
end.time <- Sys.time()
time.taken <- end.time - start.time
time.taken

在我的機器上的 RStudio 中運行它的時間是基本 R 的 5 倍。無論操作系統如何（Windows 與 Mac），我都經歷過同樣的速度減慢。

有什么解決方法嗎？

其他套餐？

具體來說，如何在不離開 RStudio 的情況下快速渲染類似： GGally::ggpairs(iris, color = "Species") ？

Answer 1

我有類似的問題，並花了一些時間試圖找出原因。 我發現了四個重要問題（不是詳盡的清單）。 如果您的情況和我一樣，那么 1 和 2 是您主要關注的問題。

1. IDE。 RStudio 執行 ggpairs 的速度比 R 慢。
2. 您的計算環境。 我沒有資源進行廣泛的測試，但我們很可能在談論 GPU，因為這是一個圖形處理問題。
3. 變量數。 更多變量=時間指數增長。
4. 順序操作。 如果您在低功耗機器上工作，則請求過多可能會減慢執行速度。

您可以在我的 github 上閱讀更多內容： https : //github.com/zstachniak/Elapsed-Time-Pairwise-Functions/blob/master/ggpairs.md