[英]Awk sum columns from 2 different matching fields
我有一個包含2個不同行標識符的數據集,我想使用2個不同行標識符獲取2個單獨列之間的比率,並將其輸出到一個單獨的文件中。
例如:
輸入項
Avpr1a CG 1 30
Avpr1a CHG 2 15
Avpr1a CHH 1 15
Avpr1a CG 2 25
Avpr1a CHG 5 15
Avpr1a CHH 8 15
BDNF CG 1 15
BDNF CHG 2 15
BDNF CHH 3 10
BDNF CG 8 20
我想要的是基於$ 1,$ 2列,得到$ 3與$ 4的總和的比值以獲得以下值(例如AVPR1a CG 3/55 = 0.05)
輸出量
Avpr1a CG 0.05
Avpr1a CHG 0.233
Avpr1a CHH 0.3
BDNF CG 0.xxx
BDNF CHG 0.xxx
BDNF CHH 0.xx
你明白了。
我目前正在通過組合各列,合並和除法來真正愚蠢地做到這一點
awk '{a[$1,$2]+=$3}END{for(i in a){print i, a[i]}}'
awk '{a[$1,$2]+=$4}END{for(i in a){print i, a[i]}}'
merge
awk and print $3/$4 from intermediate files
是否可以在單個awk命令中實現我想做的事情?
謝謝!
是的,這甚至很容易:
awk '{s1[$1,$2] = $1; s2[$1,$2] = $2; s3[$1,$2] += $3; s4[$1,$2] += $4}
END { for (i in s3) print s1[i], s2[i], s3[i]/s4[i] }' data
輸出:
Avpr1a CG 0.0545455
BDNF CHG 0.133333
BDNF CHH 0.3
Avpr1a CHG 0.233333
BDNF CG 0.257143
Avpr1a CHH 0.3
如果您沒有捕獲s1
和s2
的單獨項目,而是打印i
,則會得到帶有\\034
字符的輸出,以分隔兩個名稱文件。 您可以使用tr
修復此問題,但是不需要這樣做更簡單。
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