R：require（foo，lib.loc = bar）不會將lib.loc = bar轉發給依賴項

Question

我有一個單獨的庫文件夾。 我安裝了ks ，如下所示：

> install.packages('ks', lib='packages')

  There is a binary version available (and will be
  installed) but the source version is later:
   binary source
ks  1.9.2  1.9.4

also installing the dependencies 'KernSmooth', 'misc3d', 'mvtnorm', 'rgl', 'multi cool'

現在，我想加載這些軟件包。

> require(ks, lib.loc='packages')
Loading required package: ks
Failed with error:  'package 'KernSmooth' required by 'ks' could not be found'

也就是說， require查找ks但不查找KernSmooth因為它沒有嘗試從packages加載KernSmooth 。 我可以手動加載它：

> require(KernSmooth, lib.loc='packages')
Loading required package: KernSmooth
KernSmooth 2.23 loaded
Copyright M. P. Wand 1997-2009
Warning message:
package 'KernSmooth' was built under R version 3.1.2 

我可以再次嘗試require(ks, lib.loc='packages) ，但是它會告訴我下一個包misc3d也尚未加載。

我是否必須從庫文件夾中手動加載所有依賴項？ 我希望它可以自動工作，即如果我require(foo, bar) ， foo也將嘗試從bar加載其依賴項。

Answer 1

函數.libPaths用於獲取和設置R查找軟件包的路徑。 如果執行以下操作，則應該可以正常工作。

install.packages('ks', lib='packages')

.libPaths("packages")
require(ks)

實際上，如果您打算大量使用"packages" ，則甚至可以在安裝前對其進行設置，這默認情況下會使所有新軟件包都放在那里。

.libPaths("packages")
.libPaths()

 [1] "/home/christofer/packages" "/usr/local/lib/R/site-library" [3] "/usr/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/library" 

install.packages('ks')

 Installing package into '/home/christofer/packages' (as 'lib' is unspecified) ... 

require(ks)