[英]d3.js Heatmap legend
我已經設法根據一些樣本基因表達數據生成了一個熱圖,並且我正在根據基因表達水平為每個細胞分配一個填充。 我將顏色填充映射到colorbrewer比例,即:
var z = d3.scale.log().base(2).domain([min, max]).range([0,1]),
fills = colorbrewer.RdBu[6];
heatmapFill = d3.scale.linear().domain(d3.range(0, 1, 1.0 / (fills.length - 1))).range(fills);
…對我來說完全正常。 但是,將這些填充分配給附帶的圖例時遇到了問題,圖例具有#NaNNaNNaN
填充。
// Get data
svg.selectAll('.tile')
.data(data.melted)
.enter()
.append('rect')
.attr({
'x': function(d) { return x(d.condition); },
'y': function(d) { return y(d.geneID); },
'fill': function(d) { return heatmapFill(z(d.value)); },
'width': x.rangeBand(),
'height': y.rangeBand()
});
// Add a legend for the color values.
var legend = svg.selectAll(".legend")
.data(z.ticks())
.enter()
.append("g")
.attr({
'class': 'legend',
'transform': function(d, i) {
return "translate(" + (i * 40) + "," + (height + margin.bottom - 40) + ")";
}
});
legend.append("rect")
.attr({
'width': 40,
'height': 20,
'fill': z // Problem likely to be arising from here
});
根據我的理解,似乎無法基於z的值獲取填充的值。
這是完整的小提琴: http : //jsfiddle.net/teddyrised/jLxbawhz/2/
如果我選擇不將表達式級別映射到colorbrewer比例上,而只是映射開始和結束顏色,則腳本可以正常工作( http://jsfiddle.net/teddyrised/jLxbawhz/3/ ):
// Scale
var z = d3.scale.log().base(2).domain([min, max]).range(['white','steelblue']);
// Get data
svg.selectAll('.tile')
.data(data.melted)
.enter()
.append('rect')
.attr({
'x': function(d) { return x(d.condition); },
'y': function(d) { return y(d.geneID); },
'fill': function(d) { return z(d.value); },
'width': x.rangeBand(),
'height': y.rangeBand()
});
// Add a legend for the color values.
var legend = svg.selectAll(".legend")
.data(z.ticks())
.enter()
.append("g")
.attr({
'class': 'legend',
'transform': function(d, i) {
return "translate(" + (i * 40) + "," + (height + margin.bottom - 40) + ")";
}
});
legend.append("rect")
.attr({
'width': 40,
'height': 20,
'fill': z
});
不確定我是否完全遵循您的代碼,但是您的圖例填充功能不應該與熱圖填充功能相同嗎?
legend.append("rect")
.attr({
'width': 40,
'height': 20,
'fill': function(d) {
return heatmapFill(z(d));
}
});
更新小提琴 。
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