NetworkX中加權邊緣的顏色錯誤

Question

在處理以下問題的時間過長之后，我決定在此處發布一個帖子。

我正在嘗試設置networkx圖並根據一些權重為邊緣着色。 事實是，邊緣和顏色之間似乎存在錯誤的分配。

這是一個簡單的代碼片段。

#! /usr/bin/python
# -*- coding: latin-1 -*-
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.colors as colors

# Set Up Data
G=nx.Graph()
G.add_node(0,pos=(0,0),label='0')
G.add_node(1,pos=(0,1),label='1')
G.add_node(2,pos=(1,0),label='2')
G.add_node(3,pos=(1,1),label='3')

G.add_edge(1,2, weight=3)
G.add_edge(0,2, weight=5)
G.add_edge(1,3, weight=2)
G.add_edge(2,3, weight=1)
G.add_edge(0,1, weight=4)

# Attributes
pos = nx.get_node_attributes(G,'pos')
weights = nx.get_edge_attributes(G,'weight')
labels = nx.get_node_attributes(G,'label')

# Plot Figure
fig = plt.figure()

# Nodes
nx.draw_networkx_nodes(G,pos)
nx.draw_networkx_labels(G,pos,labels)

# Edges
out = nx.draw_networkx_edges(G,pos,edge_color = weights.values(), edge_cmap = plt.cm.jet, vmin = 0.0, vmax = max(weights.values()))
nx.draw_networkx_edge_labels(G,pos,edge_labels=weights)
plt.axis('off')

# Set Up Colorbar
cbar = plt.colorbar(out)

# Show
plt.show()

由此我得到了從邊緣到顏色的相當奇怪的分配。 有人可以解釋嗎？ 我做錯什么了嗎？

最終，我通過對顏色進行排序找到了一種解決方法。

# Store edges
sorted_edge = []
sorted_edge.append((1,2))
sorted_edge.append((0,2))
sorted_edge.append((1,3))
sorted_edge.append((2,3))
sorted_edge.append((0,1))

# Sort edges
sorted_edge = sorted(sorted_edge)

# Sort colors
new_colors = []
sorted_indices = [sorted_edge.index(edge) for edge in weights.keys()]
for index in sorted_indices:
    while len(new_colors) < index+1:
        new_colors.append(0)
    new_colors[index] = weights.values()[sorted_indices.index(index)]

首先，我認為這不是該問題的預期解決方案嗎？ 其次，我在這個小例子中有一個更大的應用，即使進行這種排序，分配也會完全失敗。 因此，我認為我最好退后一步，嘗試了解問題所在。

感謝您的回答。

最好，喬納斯

Answer 1

我嘗試了您的代碼段，並且可以重現該問題。 這可以正常工作：

edges, colors = zip(*nx.get_edge_attributes(G,'weight').items())
nx.draw(G, pos, edgelist=edges, edge_color=colors, width=10, edge_cmap = plt.cm.jet, vmin = 0.0, vmax = max(weights.values()))

我的猜測是draw_edges不能保持get_edge_attributes定義的邊緣順序，但是我不確定...

之前：

后：