使用 str.translate() 從 DNA 到 RNA

Question

我正在嘗試使用 Python 將 DNA 代碼轉換為 RNA 代碼......

我這樣寫：

print('Digite a sequência DNA a ser transcrita para RNA:')

my_str = raw_input()
print(my_str.replace('T', 'U'))

它有效，但是..現在我需要將A轉換為 U ， T 到 A ， G 到 C和C 到 G ......我看看我是怎么做到的，然后這樣做了：

print('Digite a sequência DNA a ser transcrita para RNA:')

my_str = raw_input()


RNA_compliment = {
    ord('A'): 'U', ord('T'): 'A',
    ord('G'): 'C', ord('C'): 'G'}

my_str.translate(RNA_compliment)

但我收到此錯誤：

Traceback (most recent call last):
  File "rna2.py", line 15, in <module>
    my_str.translate(RNA_compliment)
TypeError: expected a character buffer object

我做錯了什么？

Answer 1

蟒蛇3：

• str.maketrans是一個靜態方法，它返回一個可用於str.translate()的轉換表。
• 如果有兩個參數，它們必須是等長的字符串。

i, j = "ATGC", "UACG"

tbl = str.maketrans(i, j)

my_str = "GUTC"

print(my_str.translate(tbl))

[out]:
'CUAG'

使用RNA_compliment

• str.maketrans接受一個參數作為字典
• {ord('A'): 'U', ord('T'): 'A', ord('G'): 'C', ord('C'): 'G'}
  • ord()不是必需的

# dict without ord
RNA_compliment = {'A': 'U', 'T': 'A', 'G': 'C', 'C': 'G'}

tbl2 = i.maketrans(RNA_compliment)

print(my_str.translate(tbl2))

[out]:
'CUAG'

蟒蛇2：

• 如果要制作表格，請使用string.maketrans 。
• 您只能將ord與dict用於python3 ，而不能用於python2 ：

In [1]: from string import maketrans

In [2]: i, j = "ATGC", "UACG"

In [3]: tbl = maketrans(i,j)

In [4]: my_str = "GUTC"

In [5]:  my_str.translate(tbl)
Out[5]: 'CUAG'