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如何更改 R 中柵格圖層的分辨率

[英]How to change the resolution of a raster layer in R

我正在使用 R 中的幾個高分辨率柵格圖層。 我正在運行的某些分析的細節水平過高,因此我想通過降低分辨率來加快速度。

坐標系是 UTM,所以單位是米。 分辨率說它是 30, 30 (x, y)。 所以看起來這里的分辨率是30m。

有人可以告訴我如何將分辨率更改為 120m 嗎? 我已閱讀 resample() 和 projectRaster() 函數的幫助,但它們似乎需要具有所需分辨率的模板光柵,而我沒有。

這是我的柵格圖層之一的示例:

alt.utm
類:光柵層
尺寸:4572、2495、11407140(nrow、ncol、ncell)
分辨率 : 30, 30 (x, y)
范圍:421661、496511、4402939、4540099(xmin、xmax、ymin、ymax)
坐標。 參考 : +proj=utm +zone=13 +ellps=GRS80 +towgs84=0,0,0,0,0,0,0 +units=m +no_defs
數據源:在內存中
名稱:層
值:1485.127、4275.202(最小值、最大值)

您可以使用聚合分解

library(raster)

#get some sample data
data(meuse.grid)
gridded(meuse.grid) <- ~x+y
meuse.raster <- raster(meuse.grid)
res(meuse.raster)
#[1] 40 40

#aggregate from 40x40 resolution to 120x120 (factor = 3)
meuse.raster.aggregate <- aggregate(meuse.raster, fact=3)
res(meuse.raster.aggregate)
#[1] 120 120

#disaggregate from 40x40 resolution to 10x10 (factor = 4)
meuse.raster.disaggregate <- disaggregate(meuse.raster, fact=4)
res(meuse.raster.disaggregate)
#[1] 10 10

以下是如何執行此操作的示例。 (鏈接到原始)

  #########################################################################
# SubsampleImageRaster.r
#  
# This function demonstrates resampling of raster images to a new
# spatial resolution using the R raster package.
# 
# Author: Rick Reeves
# Date created: 6-October- 2010
# Date modified:                                                             
# NCEAS
#
#########################################################################
#
SubsampleImageRaster <- function()
{
   library(raster)

   sOutFile <- ""
   resampleFactor <- 4  # For test, subsample incoming image by factor of 10

# Read the mosaic components, stored in a subfolder, into a raster object list.
# Within the same loop, obtain the (geographic) extent of each component.
# Note: these images do not have same spatial extent, so they cant be stored
# in a rasterStack. Instead, use a list of rasterLayers.

   setwd("./ForUseCase")
   inFiles <- list.files(pattern="*.tif")
   nFiles <-  length(inFiles)
   inputRaster <- raster()
   CoarseResampRaster <- raster()   
   FineResampRaster <- raster()   
   for (iCtr in 1 : nFiles)
   {
      message(sprintf("resampling file: %s",inFiles[iCtr]))
      inputRaster <- raster(inFiles[iCtr])

# The aggregate() / disaggregate methods resample rasters to COARSER (bigger cells)
# and FINER (smaller cells) resolutions, respectively

      CoarseResampRaster <- aggregate(inputRaster,fact=resampleFactor,fun=mean) 
      sOutFile <- sprintf("CoarseSubsamp%s",inFiles[iCtr]) 
      writeRaster(CoarseResampRaster,filename=sOutFile,format="GTiff",datatype="INT1U",overwrite=TRUE)      
      FineResampRaster <- disaggregate(inputRaster,fact=resampleFactor,fun=mean) 
      sOutFile <- sprintf("FineSubsamp%s",inFiles[iCtr]) 
      writeRaster(FineResampRaster,filename=sOutFile,format="GTiff",datatype="INT1U",overwrite=TRUE)            
   }   

   message("resample demo")
   browser()

# second method: use the resample() method from raster package

# Simple example:
# This code produces a resampled raster, 's',
# with correct resampled values. e.g.; 
# s[] prints a vector of resampled cell values.

   r <- raster(nrow=3, ncol=3)
   r[] <- 1:ncell(r)
   s <- raster(nrow=10, ncol=10)
   s <- resample(r, s, method='bilinear')

# Useful example:
# Resample a satellite image, stored in a GeoTiff file
# into a NEW raster with 2x spatial resolution in 
# both dimensions (four times the number of cells)
# Here is the technique: 
#  1) Create a new raster object with the correct 'resampled' number of cells.
#  2) Set the extent (geographic 'bounding box') of the new raster 
#     to the extent of the original raster
#  3) Generate the resampled raster.

   resampleFactor <- .5  # reduce the cell size by 50% and double the number of rows and columns.      
   inputRaster <- raster("TmB50MosaicImg1.tif")      
   inCols <- ncol(inputRaster)
   inRows <- nrow(inputRaster)
   resampledRaster <- raster(ncol=(inCols / resampleFactor), nrow=(inRows / resampleFactor))
   extent(resampledRaster) <- extent(inputRaster)

# The resample method will write the resampled raster image to a NEW disk file..

   resampledRaster <- resample(inputRaster,resampledRaster,datatype="INT1U",method='bilinear',filename="testOutResamp.tif",overwrite=TRUE)

# Or, use writeRaster method to create the output file.

   writeRaster(resampledRaster,filename="ResampleProduct.tif",format="GTiff",datatype="INT1U",overwrite=TRUE)   


# end
}

我已經嘗試了3種不同的選項來升級DEM文件。 首先我像這樣使用gdal_translate

from CMD:
gdal_translate -tr 0.1 0.1 "C:\dem.tif" "C:\dem_0.1.tif"

在R:

res(raster('C:\dem_0.1.tif')
[1] 0.1 0.1

然后我嘗試了R中raster包的aggregateresample命令:

#
r <- raster("dem.tif")
> res(r)
[1] 0.0002777778 0.0002777778 # original dem resolution
#
r_up_0.1 <- aggregate(r, fact = 0.1/res(r)) # aggregate output
> res(r_up_0.1)
[1] 0.1 0.1
#
s <- raster(nrow = 10, ncol = 10)
extent(s) <- extent(r)
s <- resample(r, s, method = 'bilinear') # resample output
> res(s)
[1] 0.1000278 0.1000278

這些是輸出: 3個輸出被升級為res = 0.1x0.1 ,它們之間存在一些差異,但我打算使用gdal輸出。

希望這可以幫助。

這是一個遲到的答案,但創建模板柵格和使用projectRaster非常簡單。 您可以將模板光柵分辨率設置為您想要的任何值,如果您想要矩形而不是方形單元格,則包括兩個值:

# Create the template raster, with 120m cells
TEMPLATE.RASTER <- raster(extent(ORIGINAL.RASTER), resolution = 120, 
                          crs = st_crs(ORIGINAL.RASTER)$proj4string)

# Project the original raster to the new resolution
PROJECTED.RASTER <- projectRaster(from = ORIGINAL.RASTER, to = TEMPLATE.RASTER)

我喜歡創建一個模板,因為它也復制了目標 CRS。 但是,您實際上可以跳過創建模板柵格並直接在projectRaster設置分辨率和 CRS。 請檢查幫助文件,因為有計算方法等選項,這可能很重要。

這些天我們可以使用terra ,它是raster包的替代品

示例數據

library(terra)
f <- system.file("ex/elev.tif", package="terra")
r <- rast(f)

聚合柵格單元格。 從 30 到 120m 是 4 倍

a1 <- aggregate(r, 4)

您可以對行和列使用不同的因子,也可以使用不同的聚合函數(默認為“均值”)

a2 <- aggregate(r, c(2,3), fun=sum)

你也可以走另一條路並分解:

d <- disagg(a2, 2)

聚合只能組合整個單元格。 但是要合並來自不同來源的柵格數據,您可能需要匹配未對齊的柵格幾何。 在這種情況下,您可以使用resample

未對齊的SpatRaster

x <- rast(r)
res(x) <- 0.01

解決方案

x <- resample(r, x)

也可能是您想將柵格數據轉換為具有另一個坐標參考系統(“地圖投影”)的幾何圖形。 你可以這樣做:

u1 <- project(r, "+proj=utm +zone=32")

但是,與矢量數據不同,柵格數據的轉換沒有明確定義。 因此,首選方法是提供您希望輸出與之對齊的模板。 這通常是您已經從另一個數據源獲得的SpatRaster 但在這里我為示例創建了一個:

temp <- rast(xmin=264000, xmax=324000, ymin=5479000, ymax=5565000, res=100, crs="+proj=utm +zone=32")

現在使用它

u2 <- project(r, temp)

進一步閱讀

我最近要求降低ggmap對象的分辨率。 這包括提取和轉換ggmap柵格(使用Robin Lovelace的ggmap_rast()),聚合此線程中討論的柵格,然后用下面較低分辨率的柵格替換ggmap高分辨率柵格。 希望這很有用:

original_map <- get_map("New York", scale = 1) #download a map at lowest resolution
#ggmap_rast function courtesy of Robin Lovelace
original_map.rast1 <- ggmap_rast(original_map) #extract RasterStack from ggmap object

original_map.rast2 <- aggregate(original_map.rast, 2) #compress raster

rast2_length <- sqrt(length(original_map.rast2)/3)  ## find the number of cells in compressed raster

map <- ggmap::ggmap(original_map) 
# from https://stackoverflow.com/questions/44225063/plot-ggmap-image-over-raster
r <- map$layers[[2]]$geom_params$raster #pull hex raster pixel values from ggmap object
#x <- r[,] #assign values to a variable (probably unnecessary)

xx <- r[1:rast2_length,1:rast2_length] #filler values for raster to be created

rgb_map <- original_map.rast2

for(i in 1:rast2_length){
  for(j in 1:rast2_length){
    k=i*rast2_length+j
    #many rgv values are non-integers; rgb2hex requires integer
    red = as.integer(round(rgb_map$layer.1[k],0))
    green = as.integer(round(rgb_map$layer.2[k],0))
    blue = as.integer(round(rgb_map$layer.3[k],0))
    #rgb2hex from ggtern package
    xx[i,j] <- rgb2hex(red,green,blue)
    #rgb2hex is slow; export, calculate in excel, import is faster, sadly
    #xx[i,j] <- as.character(rgb_from_excel$V1[k])
  }
}

map$layers[[2]]$geom_params$raster <- xx
map

暫無
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