如何使用awk逐行打印其他程序的結果？

Question

我有一個file.txt像：

AAAAAA
AAAAAB
AAAAAC
AAAAAD
...

我想同時在另一行中使用一行。 我的腳本正在使用awk，並且幾乎完成了操作，但仍然無法正常工作。 有人可以幫忙嗎？ 謝謝！

while read file.txt

line=`awk '{ print $0 ; next}' ../file.txt`

echo 'for aa in "$line": cmd._alt(string.lower(aa)) ; save $line.pdb' > script.pdb

do

pymol script.pdb

done

該腳本應分別讀取file.txt的每一行，以在“ $ line”中的“ for aa”中使用該行：cmd._alt（string.lower（aa））; 為pymol保存$ line.pdb'腳本。

因此，預期輸出應為包含每個文件的文件夾：

AAAAAA.pdb AAAAAB.pdb AAAAAC.pdb

Answer 1

你可以試試

while read -r line
do
    echo "for aa in \"$line\": cmd._alt(string.lower(aa)) ; save $line.pdb" > script.pdb
    pymol script.pdb
done < file.txt