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如何取消組合data.table中的列列?

[英]How to ungroup list columns in data.table?

tidyr提供UNNEST功能,幫助擴大列表列。

這類似於kdb中更多(20x)更快的ungroup函數。

我正在尋找一個類似(但速度更快)的函數,假設data.table包含多個列表列,每個列在每行上具有相同數量的元素,將擴展data.table。

這是這篇文章的延伸。

library(data.table)
library(tidyr)
t = Sys.time()
DT = data.table(a=c(1,2,3),
                b=c('q','w','e'),
                c=list(rep(t,2),rep(t+1,3),rep(t,0)),
                d=list(rep(1,2),rep(20,3),rep(1,0)))

print(DT)
   a b                                                           c        d
1: 1 q                     2016-01-09 09:55:14,2016-01-09 09:55:14      1,1
2: 2 w 2016-01-09 09:55:15,2016-01-09 09:55:15,2016-01-09 09:55:15 20,20,20
3: 3 e                                                                     

print(unnest(DT))
Source: local data frame [5 x 4]

      a     b                   c     d
  (dbl) (chr)              (time) (dbl)
1     1     q 2016-01-09 09:55:14     1
2     1     q 2016-01-09 09:55:14     1
3     2     w 2016-01-09 09:55:15    20
4     2     w 2016-01-09 09:55:15    20
5     2     w 2016-01-09 09:55:15    20

這是我自己的嘗試......似乎要快2倍,但應該大大改善......

dtUngroup <- function(DT){
  colClasses <- lapply(DT,FUN=class)
  listCols <- colnames(DT)[colClasses=='list']
  if(length(listCols)>0){
    nonListCols <- setdiff(colnames(DT),listCols)
    nbListElem <- unlist(DT[,lapply(.SD,FUN=lengths),.SDcols=(listCols[1L])])
    DT1 <- DT[,lapply(.SD,FUN=rep,times=(nbListElem)),.SDcols=(nonListCols)]
    DT1[,(listCols):=DT[,lapply(.SD,FUN=function(x) do.call('c',x)),.SDcols=(listCols)]]
    return(DT1)
  }
  return(DT)
} 
dtUngroup(DT)[]
   a b                   c  d
1: 1 q 2016-01-09 09:55:14  1
2: 1 q 2016-01-09 09:55:14  1
3: 2 w 2016-01-09 09:55:15 20
4: 2 w 2016-01-09 09:55:15 20
5: 2 w 2016-01-09 09:55:15 20

使用:

na.omit(DT[, lapply(.SD, unlist), a][, c := as.POSIXct(c, origin="1970-01-01")])

得到:

   a b                   c  d
1: 1 q 2016-01-09 12:17:24  1
2: 1 q 2016-01-09 12:17:24  1
3: 2 w 2016-01-09 12:17:25 20
4: 2 w 2016-01-09 12:17:25 20
5: 2 w 2016-01-09 12:17:25 20

如果a列中的值對於每一行都不是唯一的,則可以使用:

na.omit(DT[, lapply(.SD, unlist), by=1:nrow(DT)][, c := as.POSIXct(c, origin="1970-01-01")])

一個基准測試:

> microbenchmark(dtUngroup(DT)[], jaap())
Unit: milliseconds
            expr      min       lq     mean   median       uq      max neval cld
 dtUngroup(DT)[] 3.935677 4.005596 4.189208 4.066196 4.227372 6.750338   100   b
          jaap() 1.977175 2.039830 2.094536 2.074314 2.132525 2.309848   100  a 

暫無
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