如何“從python打印中回顯php”？

Question

我正在嘗試將python矩陣轉換為php（努力解決此問題超過20個小時）。 我真的很感謝您的幫助！

下面有兩種情況：TEST和REAL。

• 測試：php的一個變量被傳遞給python。 通過將變量傳遞到python中，可以明確分配矩陣值。 此矩陣應調用php。
• REAL：php的變量傳遞給python。 與變量一起，一個文件在python中。 然后，將解析后的值分配給應調用php的矩陣。

它們具有與python運行完全相同的輸出以及相同的php代碼。 唯一的區別是，在REAL情況下，文件已在文件中放入python腳本。 TEST python本身運行良好，REAL python本身運行良好，TEST php-python運行正常，但REAL php-python運行失敗。 所以我的猜測是php不允許python將文件放入python腳本中？？ 我的代碼如下：

===========測試案例===========

===== test.py

import os, sys, json
g = json.loads( sys.argv[1] )

gene = ['>MhA1_Contig0.frz3.gene1', '>MhA1_Contig0.frz3.gene1', '>MhA1_Contig0.frz3.gene1']
gene.append(g)
seq = ["ATGGAC", "GGCACAGC", "CCACC"]
seq.append('ACTGAAA')

print json.dumps(output)

===== test.php

$output=null;
$g = "0.CUFF.6.1_2";
$data = escapeshellarg(json_encode($g));
exec("python /mysql/getSeq/test.py $data 2>&1 &", $output );
//exec("python /mysql/getSeq/test.py $data 2>&1", $output );   --> worked fine
//exec("python /mysql/getSeq/test.py $data", $output );   --> worked fine
//print_r($output);   --> worked fine
//var_dump($output);   --> worked fine

$result = json_decode( exec("python /mysql/getSeq/test.py $data", $output ) , true);
//print_r( $result);   --> worked fine 
//var_dump($result);   --> worked fine
echo $result[0][0] . "<br>";
echo $result[0][1] . "<br>";
echo $result[1][0] . "<br>";
echo $result[1][1] . "<br>";

=====網頁上的結果

>MhA1_Contig0.frz3.gene1
ATGGAC
>MhA1_Contig0.frz3.gene1
GGCACAGC

===========真實案例===========

===== real.py

import os, sys, json

inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r")
g = json.loads( sys.argv[1] )

inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r")
line = inF.readline()
matrix = []
--- (some codes here) ---
inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r")
line = inF.readline()
gene = []
--- (some codes here) ---
for i in range(len(index)) : 
    output[i][0] = ">" + gene[i]
    output[i][1]= str(matrix[i])[2:-4]

print json.dumps(output)
# print output

===== real.php

$output=null;
$g = "0.CUFF.6.1_2";
$data = escapeshellarg(json_encode($g));
exec("python /mysql/getSeq/real.py $data  2>&1 &", $output );
//exec("python /mysql/getSeq/real.py $data  2>&1", $output );  --> no difference in results
//exec("python /mysql/getSeq/real.py $data", $output );   --> no difference in results
$result = json_decode( exec("python /mysql/getSeq/real.py $data 2>&1", $output ) , true);
print_r($output) . "<br>";
//var_dump($output) . "<br>";
//print_r( $result) . "<br>";
//var_dump($result) . "<br>";
//echo $result[0][0] . "<br>";
//echo $result[0][1] . "<br>";
//echo $result[1][0] . "<br>";
//echo $result[1][1] . "<br>";

=====網頁上的結果

print_r（$ output）; ->錯誤

Array ( [0] => Traceback (most recent call last): [1] => File "/mysql/getSeq/getOne.py", line 3, in [2] => inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r") [3] => IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'getSeq_Mh.fasta' [4] => Traceback (most recent call last): [5] => File "/mysql/getSeq/real.py.py", line 3, in [6] => inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r") [7] => IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'getSeq_Mh.fasta' )

var_dump（$ output）; ->錯誤

array(8) { [0]=> string(34) "Traceback (most recent call last):" [1]=> string(95) " File "/mysql/getSeq/getOne.py", line 3, in " [2]=> string(38) " inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r")" [3]=> string(63) "IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'getSeq_Mh.fasta'" [4]=> string(34) "Traceback (most recent call last):" [5]=> string(95) " File "/mysql/getSeq/real.py.py", line 3, in " [6]=> string(38) " inF = file("getSeq_Mh.fasta", "r")" [7]=> string(63) "IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'getSeq_Mh.fasta'" } 

print_r（$ result）; ->錯誤

(nothing)

var_dump（$ result）; ->錯誤

NULL 

=========== PYTHON ITSELF ============

[['>MhA1_Contig0.frz3.gene1', 'ATGGACT'], ['>MhA1_Contig0.frz3.gene1', 'GGCACAGC'], ['>MhA1_Contig0.frz3.gene1', 'CCACC']]

Answer 1

考慮使用PHP的proc_open（）處理子處理（輸入/輸出）； 這里的子進程是Python腳本。 下面在命令行中調用Python，傳遞$data參數並接收$output參數。

做出兩個可能需要最終調整的假設： python是服務器上的路徑變量，Python腳本與PHP腳本位於同一目錄中。 如果不是，請在命令行中插入python.exe的完整路徑，和/或在命令行中將目錄的完整路徑插入real.py。

$output=null;
$g = "0.CUFF.6.1_2";
$data = escapeshellarg(json_encode($g));

$cd = dirname(__FILE__);                       // CURRENT DIRECTORY OF SCRIPT
$output = null;

$descriptorspec = array(
   0 => array("pipe", "r"),
   1 => array("pipe", "w"),
   2 => array("file", $cd."/error.txt", "a")   // ERROR TXT OUTPUT OF PROCESSING
);

/* CALLING COMMAND LINE */
$process = proc_open("python \"$cd/real.py\" \"$data\"" , $descriptorspec, $pipes, $cd); 

/* RECEIVING OUTPUT */
$output = stream_get_contents($pipes[1]);
fclose($pipes[1]);
proc_close($process);

echo $output;

Answer 2

解決了 當我將所有文件（“ real.py”，“ real.php”和“ getSeq_Mh.fasta（已歸檔到real.py）”）放在同一目錄中時，它可以工作。

謝謝，凍糕。 您的稱贊給了我一個提示。