如何直接從Github編譯R軟件包二進制文件？

Question

devtools軟件包提供了通過install_github命令從Github安裝軟件包的install_github 。

使用devtools軟件包中的build命令，可以從本地文件夾編譯R軟件包二進制文件。

是否還可以使用build從Github文件夾直接編譯（而不是安裝）R軟件包二進制文件，例如build("https://github.com/user/rpackage") ？

Answer 1

有趣的問題。 我沒有意識到為此目的而構建的功能，但這並不意味着它是不可能的。 我根據學習了一些研究從devtools軟件包中導出的未導出函數的知識后，為此編寫了一個函數，具體來說，

# devtools:::git_remote
# devtools:::remote
# devtools:::install_remotes
# devtools:::try_install_remote
# devtools:::install_remote
# devtools:::install
# devtools:::R 
# devtools:::remote_download.git_remote

函數build_from_git將要求您安裝devtools和git2r 。 此函數將獲取git服務器上托管的R包的url，創建一個臨時目錄，克隆存儲庫，構建該包，將.tar.gz移至工作目錄，然后刪除臨時文件。

請注意，在這項工作中我經常使用::: ，通常不建議這樣做，如Writing R Extensions手冊中所述。 但是，當您需要/想要使用另一個軟件包中的非導出函數時，這是一種合理的編程方法。 參數與devtools::install_git的參數相同。

build_from_git <- function(url, subdir = NULL, branch = NULL, credentials = NULL, progress = interactive()) {
  grmt <- devtools:::git_remote(url, subdir = subdir, branch = branch, credentials = NULL)

  bundle <- "__temp__"
  git2r::clone(grmt$url, bundle, credentials = grmt$credentials, progress = progress)

  if (!is.null(grmt$branch)) {
    r <- git2r::repository(bundle)
    git2r::checkout(r, grmt$branch)
  }
  on.exit(unlink(bundle, recursive = TRUE), add = TRUE)

  sourcepkg <- devtools::as.package(devtools:::source_pkg(bundle, subdir = grmt$subdir))
  on.exit(unlink(sourcepkg, recursive = TRUE), add = TRUE)

  devtools:::R("CMD build . ", path = "__temp__")
  system("mv __temp__/*.tar.gz .")
}

使用示例：

build_from_git(url = "https://github.com/dewittpe/qwraps2.git", progress = interactive())

您應該在工作目錄中看到.tar.gz文件。

以上工作的會話信息為：

> sessionInfo()
R version 3.4.1 (2017-06-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Debian GNU/Linux 9 (stretch)

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3
LAPACK: /usr/lib/libopenblasp-r0.2.19.so

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.1  withr_1.0.2     memoise_1.1.0   git2r_0.19.0   
[5] digest_0.6.12   devtools_1.13.2