提高MySQL的查詢性能

Question

我發布這個帖子是為了對我的SQL查詢的性能提出一些建議。 我實際上有兩個表，一個用大約44657169行調用HGVS_SNP ，另一個在run表上調用，平均有2000行。 當我嘗試更新我的run table字段注釋時，執行查詢需要花費很多時間。 我想知道是否有任何方法來增加我的SQL查詢。

HGVS_SNP結構表：

+-----------+-------------+------+-----+---------+-------+
| Field     | Type        | Null | Key | Default | Extra |
+-----------+-------------+------+-----+---------+-------+
| snp_id    | int(11)     | YES  | MUL | NULL    |       |
| hgvs_name | text        | YES  |     | NULL    |       |
| source    | varchar(8)  | NO   |     | NULL    |       |
| upd_time  | varchar(32) | NO   |     | NULL    |       |
+-----------+-------------+------+-----+---------+-------+

我的運行表具有以下結構：

+----------------------+--------------+------+-----+---------+-------+
| Field                | Type         | Null | Key | Default | Extra |
+----------------------+--------------+------+-----+---------+-------+
| ID                   | varchar(7)   | YES  |     | NULL    |       |
| Reference            | varchar(7)   | YES  | MUL | NULL    |       |
| HGVSvar2             | varchar(120) | YES  | MUL | NULL    |       |
| Comment              | varchar(120) | YES  |     | NULL    |       |
| Compute              | varchar(20)  | YES  |     | NULL    |       |
+----------------------+--------------+------+-----+---------+-------+

這是我的查詢：

UPDATE run
INNER JOIN SNP_HGVS 
ON run.HGVSvar2=SNP_HGVS.hgvs_name
SET run.Comment=concat('rs',SNP_HGVS.snp_id) WHERE run.Compute not like 'tron'

Answer 1

我猜你自己加入一個帶有VARCHAR（120）列的文本列，你真的不需要一個文本列。 將其設為VARCHAR，以便對其進行索引

ALTER TABLE `HGVS_SNP` modify hgvs_name VARCHAR(120);

ALTER TABLE `HGVS_SNP` ADD KEY  idx_hgvs_name (hgvs_name);

大型桌子需要一段時間

現在你的JOIN應該快得多，同時在計算列上添加一個索引

ALTER TABLE `run` ADD KEY  idx_compute  (compute);

並且LIKE是不必要的，改為

WHERE run.Compute != 'tron'