MonetDB嵌入式R代碼調試

Question

在我努力解決這里提到的問題： MonetDB連接到在數據庫中運行的R代碼中的GO.db

我繼續將我需要的WGCNA代碼復制到我自己的軟件包並安裝它。 顯然，我現在可以加載包沒有任何問題（因為我不需要GO.db部分）。

但是，我似乎遇到了另一個問題：

服務器說'！運行R表達式時出錯。 錯誤消息：.C中出錯（“corFast”，x = as.double（x），nrow = as.integer（nrow（x）），ncolx = as.integer（ncol（x）），：'。

我確實想使用WGCNA中更快的cor函數，但顯然C調用現在會產生另一個問題。 不幸的是，該消息並不提供信息。 我已經嘗試以交互方式運行查詢並將語句添加到語句中。 這並沒有為我提供更多信息。

我能做些什么來增加冗長度，以便我可以調試過程嗎？

我也嘗試過：

options(monetdb.debug.query=F)

這會在查詢之前產生一些額外的輸出，但是在發生的錯誤上沒有額外的輸出。

根據Hannes Muehleisen的建議，我補充說：

options(monetdb.debug.mapi=T)

它確實添加了一些信息，這讓我可以繼續前進。 我現在卡在以下錯誤，似乎再次被截斷。

QQ：'SELECT * FROM cor_test（）;' TX：'sSELECT * FROM cor_test（）; ; RX：'！運行R表達式時出錯。 錯誤消息：.C中出錯（“corFast”，x = as.double（x），nrow = as.integer（nrow（x）），ncolx = as.integer（ncol（x））,:！“corFast”不適用於.C（）包“MRMRF .local中的錯誤（conn，statement，...）：無法執行語句'SELECT * FROM cor_test（）;'。服務器說'！運行R表達式時出錯。錯誤信息：.C中的錯誤（“corFast”，x = as.double（x），nrow = as.integer（nrow（x）），ncolx = as.integer（ncol（x）），：'。

Answer 1

是的，這是一個已知問題，只返回錯誤消息的第一行。 我們應該解決這個問題 我總是使用stop(whatever)從UDF中返回一些信息。