如何合並不以某些字符開頭的行

Question

如果我有以下內容：

>A13P0
ACCATAGAGAG
CCCGAGATTTA
>03HK2
ACACAGTGTGT
TTAGAGGGAGA

如何合並不以>開頭的行？

即

>A13P0
ACCATAGAGAGCCCGAGATTTA
>03HK2
ACACAGTGTGTTTAGAGGGAGA

謝謝！

Answer 1

perl -ne'
   if (/^>/) {
      print("\n") if $. != 1;
   } else {
      chomp;
   }
   print;
} {
   print("\n") if $. != 1;
'

請參閱指定要處理的文件以Perl單線進行使用。

Answer 2

我知道這個問題已經被問了一千遍了，但是我找不到它：

$ awk '/^>/{print (NR>1?ORS:"") $0; next} {printf "%s", $0} END{print ""}' file
>A13P0
ACCATAGAGAGCCCGAGATTTA
>03HK2
ACACAGTGTGTTTAGAGGGAGA

Answer 3

使用perl命令行：

perl -pE '$.>1 && !s/^>/\n>/ && chomp; END{say}' file

Answer 4

與sed：

$ sed ':a;$!N;/>/!{s/\n\([^>]\)/\1/;ta};P;D' file
>A13P0
ACCATAGAGAGCCCGAGATTTA
>03HK2
ACACAGTGTGTTTAGAGGGAGA