R（Ubuntu） - 無法安裝軟件包“readr”和“eurostat”

Question

我在R中安裝“eurostats”軟件包時出現問題。在解決問題之后，我推斷問題在於“readr”軟件包。 嘗試安裝它，會發生這種情況：

* installing *source* package ‘readr’ ...
** libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/home/shiny/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -I"/home/shiny/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/BH/include"   -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c Collector.cpp -o Collector.o

之后終端只是凍結，好像它是活躍的但沒有任何反應。在此之前，我有點處理區域設置（如果它有幫助就提到它）。 我能夠安裝其他軟件包。

我的R和Linux詳細信息如下：

sessionInfo()
R version 3.3.2 (2016-10-31)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.1 LTS

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] httr_1.2.1      R6_2.2.0        tools_3.3.2     withr_1.0.2    
[5] curl_2.2        memoise_1.0.0   git2r_0.16.0    digest_0.6.10  
[9] devtools_1.12.0

有人可以幫幫我嗎？

Answer 1

您的計算機上沒有足夠的RAM。 所以你有兩個選擇：

• 繼續你正在做的事情，並嘗試從源代碼編譯，這將需要更多的內存，並可能會失敗

• 安裝一個預先構建的二進制文件（!!），這樣你就不必在第一時間編譯

最簡單的方法是這樣的（我在Ubuntu 16.04的Docker實例中只顯示命令而不顯示輸出，我在Docker中執行此操作，其中帳戶是root ;否則在前面添加sudo ）

apt-get update     # refresh
apt-get install software-properties-common
add-apt-repository -y "ppa:marutter/rrutter"
add-apt-repository -y "ppa:marutter/c2d4u"
apt-get update     # now with new repos
apt-get install r-cran-readr

瞧，你有readr包。 現在繼續使用未打包為二進制文件的eurostat，但由於其C ++代碼，可能不需要更大的資源。

Answer 2

我的覆盆子pi也有同樣的問題。 解決方法是增加交換的大小（在我的情況下增加到1Gb）。 以下是步驟：

sudo swapon -s #get size and filename
sudo swapoff -a #stop the actual swaps
sudo fallocate -l 1g swap2 #allocate 1Gb for the swapfile
sudo mkswap swap2
sudo swapon swap2

啟動R並安裝軟件包。

如果您需要返回以前的配置：

sudo swapoff -a
sudo rm swap2
sudo swapon your-previous-swap