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處理功能錯誤,通知然后跳過

[英]Handling error in function, notify then skip

我在處理一個函數時遇到麻煩,該函數既可以將回歸摘要輸出到csv文件,也可以進行回歸分析。 因此,代碼如下所示:

我有三個預測變量:age1(連續),gender1(類別0/1),FLUSHOT(類別0/1)

在文件中,前100列是我要測試的響應變量(均為0/1類別)。

目標是使用每個響應變量(1:100)進行回歸分析,並且僅輸出p值,OR和CI。

所以我擁有的代碼如下所示:

fun1<-function(x){
  res<-c(paste(as.character(summary(x)$call),collapse = " "),
         summary(x)$coefficients[4,4],
         exp(coef(x))[4],
         exp(confint(x))[4,1:2],"\n")

  names(res)<-c("call","p-value","OR","LCI","UCI","")
  return(res)}


res2=NULL
lms=list()
for(i in 1:100)
{
  lms[[i]]=glm(A[,i]~age1+gender1+as.factor(FLUSHOT),family="binomial",data=A)               
  res2<-rbind(res2,fun1(lms[[i]]))
}
write.csv(res2,"A_attempt1.csv",row.names=F)

例如,如果我們在每個類別中都有足夠的樣本量,或者邊際頻率如下所示:

table(variable1,FLUESHOT)
   0    1
0  15   3
1  11   19

這段代碼很好用,但是如果我們有類似的東西:

 table(variable15,FLUESHOT)
       0    1
    0  15   0
    1  11   19

代碼遇到錯誤,報告並停止。

我嘗試了使用try()tryCatch()多種方法,但似乎對我沒有用。

您看到什么錯誤消息? 您可以嘗試使用rms包中的lrm來估計邏輯回歸模型。 和texreg將其輸出到csv。

暫無
暫無

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