R包不能安裝在Jupyter筆記本中，但安裝在RStudio和R app中

Question

我正在嘗試使用Jupyter筆記本中的以下代碼安裝PerformanceAnalytics包，我已經用它成功安裝了許多軟件包，例如ggplot2，代碼如下：

install.packages("PerformanceAnalytics", repos='http://cran.r-project.org')

但我讀到許多其他問題，添加dependencies=TRUE將解決問題。 不幸的是，它沒有。 我一直收到以下錯誤消息。

install.packages("PerformanceAnalytics", repos='http://cran.r-project.org', 
dependencies=TRUE)

Warning message in install.packages("PerformanceAnalytics", repos = 
"http://cran.r-project.org"): “installation of package ‘PerformanceAnalytics’ 
had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

該軟件包安裝在R app和RStudio中沒有問題。 Jupyter是否需要這個特定包裝？ 我正在使用macOS 10.12.5。 下面是我運行sessionInfo()時的信息。

R version 3.3.2 (2016-10-31)
Platform: x86_64-apple-darwin11.4.2 (64-bit)
Running under: macOS Sierra 10.12.5

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] R6_2.2.0        magrittr_1.5    IRdisplay_0.4.4 pbdZMQ_0.2-4   
 [5] tools_3.3.2     crayon_1.3.2    uuid_0.1-2      stringi_1.1.2  
 [9] IRkernel_0.7.1  jsonlite_1.1    stringr_1.1.0   digest_0.6.10  
[13] repr_0.10       evaluate_0.10  

Answer 1

問題的解決方案是否可以在R Jupyter筆記本中安裝bioconductor包'rain'？ 我的問題也解決了。 我使用的是Anaconda版本的R.我卸載了Anaconda，而是手動安裝了Jupyter Notebook和IRkernal，解決了我的問題。 有關詳細信息，請參閱上面鏈接的答案。