從源代碼重新加載自定義R包

Question

我創建了一個自定義程序包，並希望將其部署到遠程計算機上。 這是我當前的冗長工作流程：

• 創建自定義包“ my_package_0.1.0.tar.gz”
• scp包到遠程計算機
• 創建遠程會話
• install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz")
• library('my_package')

當其他人連接到計算機時，他們必須運行安裝和庫：

• install.packages("/path/to/my_package0.1.0.tar.gz")
• library('my_package')

有沒有一種方法可以共享自定義程序包並使工作流程為：

• 創建遠程會話
• 用library('my_package')加載包library('my_package')

Answer 1

意見反饋指出，最佳做法是將軟件包安裝在共享位置。

這是您找到安裝軟件包的好地方的方法。

運行以下命令顯示從何處加載庫

.libPaths()
# rserve2 rserve2 /opt/deployr/9.0.1/rserve/R
#root root        /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/library

R服務器正在尋找庫的兩個位置。 一個由root擁有，因此我們不應該在這里部署。 rserve2的另一個位置擁有所有權，並且看起來很有希望。 我們應該創建一個library子文件夾來存儲共享包。

基於此信息，工作流程應為：

• 創建自定義包“ my_package_0.1.0.tar.gz”
• scp包到遠程計算機
• 創建遠程會話
• install.packages（“ / path / to / my_package0.1.0.tar.gz”， lib ='/ opt / deployr / 9.0.1 / rserve / R / library /' ）
• 庫（ 'my_package'）

當其他人連接到計算機時，他們可以加載共享庫：

• 庫（ 'my_package'）