[英]Only one bar when making stacked barplot as annotation
我正在嘗試制作堆疊式條形圖作為熱圖上的列注釋。 我使用ComplexHeatmap
。
這是條形圖的輸入(foo):
V1 V2 V3
1 28.50 67.30 0.00
2 0.00 63.90 25.40
3 16.30 67.80 15.90
4 24.10 75.30 0.00
5 0.00 70.90 20.60
6 18.90 62.50 13.90
7 19.80 68.70 11.50
8 22.60 64.90 10.10
9 28.10 66.80 0.00
10 16.60 74.30 0.08
11 0.14 79.90 0.06
12 23.70 0.71 0.00
13 26.70 66.60 0.00
14 16.80 58.20 20.60
15 13.30 82.20 0.00
16 0.32 61.70 6.30
17 21.50 62.20 0.14
為簡單起見,我刪除了其他注釋和熱圖,僅制作了“麻煩的”注釋圖。 這是我的代碼:
library(ComplexHeatmap)
ha = HeatmapAnnotation(barplot = anno_barplot(foo), annotation_height = unit(30,"mm"))
hm = Heatmap(zero_row_mat, top_annotation = ha)
hm
閱讀ComplexHeatmap
參考手冊,由於輸入是matrix
(多於1列),所以我希望有一個堆積的條形圖,但是我只能得到一個條形圖。 我不知道自己在做什么錯。 有任何想法嗎?
沒錯,當我跑步時:
DF <- data.frame( A = rep(c(0,5), 5), B = 2:11, C = 3:12 )
hb = HeatmapAnnotation(barplot = anno_barplot(DF), annotation_height = unit(30,"mm"))
hm = Heatmap(matrix(1:10,nrow=1), top_annotation = hb)
hm
我得到一個堆積的條形圖。 你得到了什么?
聲明:本站的技術帖子網頁,遵循CC BY-SA 4.0協議,如果您需要轉載,請注明本站網址或者原文地址。任何問題請咨詢:yoyou2525@163.com.