如何打印每個ID的最后一行？

Question

我有一個ID（外顯子）列表，每個ID具有多個后綴，我想獲取每個ID的最后一行

輸入：

NM_203_exon_19
NM_203_exon_20
NM_0217_exon_7
NM_0217_exon_8
NM_0217_exon_9
NM_91_exon_14
NM_91_exon_15
NM_91_exon_16
NM_91_exon_17

所需的輸出：

NM_203_exon_20
NM_0217_exon_9
NM_91_exon_17

Answer 1

tac INPUTFILE |awk -F'_' '!a[$1FS$2]++' |tac
NM_203_exon_20
NM_0217_exon_9
NM_91_exon_17

Answer 2

掃描每一行時，可以檢查是否存儲了先前的“ ID”，如果新的“ ID”不同，則可以打印出來：

$ awk -F'_exon_' '{if($1 != id && last)print last; id=$1; last=$0} END{print last}' file
NM_203_exon_20
NM_0217_exon_9
NM_91_exon_17

Answer 3

當您的列表被排序時，一個想法可以將所有內容放入數組並迭代通過（不使用awk），當您更改String時，意味着前一個是最大的，您將打印它，而不會得到最后一個，您將在最后打印數組的最后一項。

!/usr/bin/bash
fileString=$(cat  filename |tr "\n" " ")
array=($fileString)
for ((i=0; i < ${#array[@]}-1; i++))
do
  if [${array[$i]} != ${array[$i+1]}]; THEN 
    echo ${array[$i]}
  fi
done
   echo ${array[${#array[@]}-1]}

Answer 4

由於文件已經按照每個ID的后綴排序，因此請為每個ID打印最后一行

awk -F"_" 'NR==1{prev=$2}; $2==prev{a=$0} $2!=prev{print a; prev=$2} END{print $0}' file

輸出：

NM_203_exon_20
NM_0217_exon_9
NM_91_exon_17

Answer 5

使用GNU -s排序（穩定排序）：

$ tac file | sort -t_ -k2,2 -su
NM_0217_exon_9
NM_203_exon_20
NM_91_exon_17