來自多個文件的Grep值

Question

我有一個名為A.nam的文件（一萬行），帶有一些坐標，即

K6662028

K6703908

K6605560

我必須從九個列（B1.txt .... B900.txt）的900個文件中復制它。 我希望在所有文件中搜索這些坐標（我已經知道所有文件都包含這些坐標），然后希望對三個感興趣的列進行grep。 我的一根襯紙可以很好地處理一個文件，但對於900個文件，我想我必須循環播放，但是如何？

我的一線是

cat A.nam |xargs -i grep -P '{}' B1.txt |awk '{print $1"\t"$2"\t"$9}' > test.txt

如果有人可以提供幫助，我將不勝感激。

Answer 1

您的一支班輪工作不錯。 您可以對其進行一個小的更改，它將很好地工作。

當給定多個文件時， cat命令將它們一個接一個地分配到stdout，因此cat ab會將cat文件a后面跟文件b ，就像它們是一個文件一樣。

舉例來說，如果我有200個文件，這些文件都喜歡1001.out ， 1002.out ， 1003.out ... 1200.out我可以cat所有的人都像這樣： cat 1*.out

因此，例如，如果您的文件在開頭都是B，在結尾是.txt的某種組合，例如B1.txt ... B900.txt示例，則您的班輪可以更改為：

cat B*.txt |xargs -i grep -P '{}' B1.txt |awk '{print $1"\\t"$2"\\t"$9}' > test.txt

Answer 2

grep可以使用包含模式的文件名-f選項。 我想你要

grep -F -w -f A.nam B*.txt | awk -v OFS="\t" '{print $1, $2, $9}' > test.txt

我在想您要-F指定您的模式是固定字符串而不是正則表達式，並且-w強制字符串匹配整個單詞。