“數據”不是從“命名空間：my_package”導出的 object

Question

我正在編寫一個使用如下外部數據的 function：

首先檢查數據是否在data /文件夾中，如果不在，則創建data /文件夾，然后從github下載文件；

如果數據已經在data/文件夾中，它會讀取它並執行計算。

問題是，當我運行時：

devtools::check()

它返回：

Error: 'data' is not an exported object from 'namespace:my_package'

我應該手動在NAMESPACE上放一些東西嗎？

一個例子：

my_function <- function(x){
if(file.exists("data/data.csv")){
    my_function_calculation(x = x)
  } else {
    print("Downloading source data...")
    require(RCurl)
    url_base <-
 getURL("https://raw.githubusercontent.com/my_repository/data.csv")
    dir.create(paste0(getwd(),"/data"))
    write.table(url_base,"data/data.csv", sep = ",", quote = FALSE)
    my_function_calculation(x = x)
  }
}

my_function_calculation <- function(x = x){
    data <- NULL
    data <- suppressMessages(fread("data/data.csv"))
    #Here, I use data...
    return(data)
}

Answer 1

它不可能在每種情況下都相同，但我通過刪除R/文件夾中的data.R文件解決了這個問題。

data.R是描述包中所有數據的文件。 從我的代碼的上一個版本開始，我就有了它，它內置了數據，而不是遠程（要下載）。 刪除文件解決了我的問題。

數據示例.R：

#' Name_of_the_data
#'
#' Description_of_the_Data
#'
#' @format A data frame with 10000 rows and 2 variables:
#' \describe{
#'   \item{Col1}{description of Col1}
#'   \item{Col2}{description of Col2}
#' }
"data_name"

Answer 2

通常，當data文件夾中的一個 rda 文件的名稱與R/data.R中描述的名稱不匹配時，就會發生這種情況。

在這種情況下，錯誤消息中的data引用是針對data.csv的，而不是針對data文件夾的。 您需要在 R 包的data文件夾中有 rda 文件。 如果你想下載 csv，你需要把它們放在inst/extdata中。

話雖如此，您可能需要考慮使用tempdir()將這些文件保存在會話的臨時文件夾中。

Answer 3

無需刪除/R文件夾中的data.R ，您只需要圍繞NULL關鍵字裝飾文檔，如下所示：

#' Name_of_the_data
#'
#' Description_of_the_Data
#'
#' @format A data frame with 10000 rows and 2 variables:
#' \describe{
#'   \item{Col1}{description of Col1}
#'   \item{Col2}{description of Col2}
#' }
NULL

Answer 4

有3件事要檢查：

1. 該文檔被適當地命名為：

#' Name_of_the_data
#'
#' Description_of_the_Data
#'
#' @format A data frame with 10000 rows and 2 variables:
#' \describe{
#'   \item{Col1}{description of Col1}
#'   \item{Col2}{description of Col2}
#' }
data

2. RData 文件在 data/ 文件夾中被適當地命名為導出。

3. 使用名稱數據加載RData 文件。

如果文檔 (1) 是 A，則 Rdata 文件是 A.RData (2)，但是對象（使用load()加載時）被命名為 B- 你會得到這個錯誤。

Answer 5

當我被錯誤難住時

Error: 'data' is not an exported object from 'namespace:my_package'

MrFlick 上面的評論救了我。 我只是在我的數據文件夾中更改了一個 .rda 文件的名稱。 我無法讓 devtools::document() 重新創建 NAMESPACE 文件。 解決方案是將數據重新保存到 .rda 文件中。 （當然我應該記住，當從 .rda 文件加載時，R 對象的名稱與 .rda 文件的名稱無關，因此重命名 .rda 文件並沒有多大作用。）

Answer 6

我花了幾個小時試圖解決這個問題。 終於讓它工作了。

筆記：

1. 數據文件必須是“rda”類型。 “rds”不起作用。
2. 文件名必須小寫。
3. 文檔名稱中的 NULL 對我不起作用。 必須是小寫字符串。

通常，似乎相同的錯誤消息是由幾件事引起的。 檢查器不喜歡與數據文件相關的任何內容，它都會發出相同的錯誤。 在這種情況下很難調試。

Answer 7

我將添加另一個陷阱。 在 RStudio 中工作，我已經為MyString分配了一個字符串並保存在我的包項目的數據文件夾中：

save(MyString, file="./data/MyString.RData")

我的./R/data.R文件包含以下文檔：

#' A character string
#'
"MyString"

這行得通。 但是您必須為每個對象使用一個文件，而不是save(X, Y, Z, file="BitsAndPieces.RData")然后記錄BitsAndPieces 。 如果你這樣做，那么你會得到這個問題的錯誤。 我做到了，不用說。

Answer 8

我有同樣的錯誤，我將能夠克服以下錯誤。

數據文件位於： data/df.RData
R 文檔文件位於： R/df.R

我通過將df.RData文件導入 R 並使用save()函數創建.RData文件來創建df.txt文件。 我使用以下代碼塊創建.RData文件。

x=read.table("df.txt")
save(x,file="df.RData")

然后在運行 RCMD 檢查后，我得到了與 df 不是從命名空間“包名”導出的對象相同的錯誤。

我已經通過將df.RData文件的變量名稱更改為

df=read.table("df.txt")
save(df,file="df.RData")

Answer 9

重新啟動會話為我解決了這個問題。 不知何故，環境是空的，重新啟動后所有對象都回來了，因此解決了差異。

Answer 10

我的一個包裹也有同樣的問題，我需要添加

LazyData: true

到我的說明文件。

Answer 11

我遇到了這個問題，因為我將.rda文件復制到了R\data文件夾中。

問題已通過使用usethis::use_data(DataObject)解決，它會自動獲取原始數據 ( DataObject ) 文件並將其添加到 R 包目錄中的R\data文件夾中。

Answer 12

問題可能是因為您的 object 在保存時是如何命名的。

假設我加載了一個名為“d”的文件，然后我將它保存（如建議的那樣）並在 data/ 目錄中保存為“data”：

save(d, file = "data/data.rda")

然后您將運行干凈並安裝 package，您將收到以下錯誤：

Error: 'data' is not an exported object from 'namespace:YourPakage'

看起來你如何在 roxygen 文檔中聲明你的 object 並不重要。 我猜你必須用相同的名稱命名你的 OBJECT，你要保存並加載它。

例如，將您的數據集加載為“pib”object，然后保存為“pib.rda”並在 roxygen“loadData.R”（例如）您的“pib”中聲明。

#' Datos del PIB
#'
#' @docType data
#'
#' @usage data(pib)
#'
#' @format An object of class ...
#'
#' @keywords datasets
#'
#' @references ----
#'
#' @source ----
#'
#' @examples
#' data(pib)
"pib"

Answer 13

我在嘗試以下操作時遇到了這個“錯誤：'weekly' 不是從 'namespace:ISLR'' 導出的對象：

library(ISLR)

w <- ISLR::weekly

通過將其更改為以某種方式解決了該問題：

w = ISLR::weekly

=符號在這里起到了重要作用。