在列表上使用mv命令並重命名每個文件

Question

我正在嘗試將已分析的某些圖像從一個文件夾移動到新文件夾，並重命名它們。 每個文件（我們將稱為file.nii）在每個患者文件夾中都具有相同的名稱，並且我希望在移動它們時根據其患者ID對其重命名。 我已經創建了一個列表（將其稱為dti.txt），並且了解它需要看起來像下面發布的內容：

    for ii in $(cat dti.txt); do cd ${INFINITE_MRI_DATA}/${ii}; 
    mv file.nii destination; done

我堅持要嘗試重命名每個與患者ID相對應的文件，因此file.nii將變為117.nii，119.nii，依此類推。 如果有幫助，他們的患者ID在列表的文件路徑中。 這是完整文件路徑的樣子：

    /gandg/infinite/imaging_data/individuals/inf0238/1/dti/dtifit/analysis/

如果這是一個愚蠢的問題或格式不正確，我深表歉意。 我還是編碼世界的新手。 感謝您的幫助！

Answer 1

您必須從父目錄中提取患者ID，這是使用路徑/my/mri/da​​ta/117/file.nii（其中117是患者ID）的一個示例：

patientId=$(readlink -f $ii | dirname | cut -f'/' 4)

然后，您可以將其用作新文件名的前綴

mv $oldfile ${patientId}_mri.nii 

例如

Answer 2

Create one file in that file put the path which consist of patient id

 i created k.txt file and mentioned the path

 cat k.txt
/my/dir/117/ol
/my/dir/118/ol

for i in `awk -F "/" '{print $4}' k.txt`; do for j in 1.txt 2.txt; do mv $j $i.nii; done;done

Used below command  to rename the old file with patientid.nii

where 1.txt 2.txt is old files