將一個Nifti標頭復制到另一個

Question

我在matlab中有一個“ prob_map”變量（一個概率圖），我想將其保存為“ .nii”格式。 我用兩行代碼做到了：

 nii = make_nii(prob_map); 
 save_nii(nii,'prob.nii');

此操作已成功完成，但是標頭信息與我的原始CT圖像“ img.nii”不兼容（因此，在ITK-SNAP軟件中無法將prob_map覆蓋在圖像上）。 我想在保存之前將img.nii的頭復制到'prob.nii'頭。 實際上，我想盡可能復制一個人的標題。 例如，不能復制標題大小，而可以復制方向和其他信息。 有什么功能可以在保存nii之前將其標頭復制到另一個標頭？ 必須復制哪些信息才能使兩個nii保持相同？

Answer 1

您可以嘗試使用spm matlab庫

# Grab header from an existing file (and optionally, get the data)
HeaderInfo  = spm_vol('img.nii')          # use spm_vol to read file header
NiftiData   = spm_read_vol(HeaderInfo)    # use spm_read_vol to get data

# Update the header contents to correspond with your new data
HeaderInfo.fname = 'prob.nii';
HeaderInfo.private.dat.fname = HeaderInfo.fname;

# Save the file with the adapted Header
spm_write_vol(HeaderInfo,Data);           # where Data is your image array