沒有這樣的文件或目錄（R 中的錯​​誤）

Question

我想在一個數據框中導入和綁定一組 .csv 文件。 我創建了一個文件列表，然后創建了一個 for 循環來讀取每個文件並將它們綁定在一起。 但是，在第二個文件中，我收到一條錯誤消息，指出缺少此類文件或目錄。 但是它確實存在於我創建的文件列表中。 請問有什么關於這個問題的建議嗎？ 謝謝你。

file.names <- list.files(path = pathname, pattern = " trial.csv")

for(i in seq(file.names)){
  file1 <- read.csv(file.names[i], header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)
  file1 <- t(file)
  file1 <- data.frame(file, stringsAsFactors = FALSE)
  colnames(file1) = file1[1,]
  print(file1)
}

Answer 1

默認情況下， list.files()返回沒有目錄詳細信息的文件名。 導入文件時，您通常希望設置full.names = TRUE以返回絕對路徑（包括目錄名稱）。

一個好的代碼模式如下。

library(assertive.files)
files_to_import <- list.files(some_path, full.names = TRUE)
assert_all_are_existing_files(files_to_import)
data <- lapply(files_to_import, read.csv)

Answer 2

我想在一個數據框中導入和綁定一組 .csv 文件。

@richie-cotton 提供了一個解決您路徑問題的答案，但我想解決您問題中突出顯示的部分。

Richie Cotton 的代碼：

library(assertive.files)
files_to_import <- list.files(some_path, full.names = TRUE)
assert_all_are_existing_files(files_to_import)
data <- lapply(files_to_import, read.csv)

將以data結尾，一個 data.frames 列表。 您希望這些成為一個data.frame 。 看看這個對類似問題的回答： https : //stackoverflow.com/a/18489830/5333994

我的建議是使用結束rbindlist所產生的名單上data.frame 。

library(data.table)
data <- rbindlist(data)

事實上，如果你打算使用data.table你可以用fread替換read.csv這可能會加快速度。

library(data.table)
library(assertive.files)
files_to_import <- list.files(some_path, full.names = TRUE)
assert_all_are_existing_files(files_to_import)
data <- rbindlist(lapply(files_to_import, fread))

如果您想以data.frame而不是data.table只需使用setDF 。

setDF(data)

如果你想避免一起使用data.table ，運行do.call可能是你最好的選擇。

data <- do.call("rbind", data)

請注意我上面鏈接的答案，這可能比使用rbindlist慢得多，具體取決於您擁有的文件數量。