是否可以在github上放置R代碼的自述文件，以顯示輸出？

Question

最近，我參加了Siraj Raval 發起的 Linkedin上的＃100daysofmlcode挑戰。 我在R中進行所有編碼。但是，當我在Github上為我的rcode推送RMarkdown文件或自述文件時，它不會顯示從代碼生成的輸出。 這使得觀看者很難跟上解釋。 有沒有一種方法可以顯示代碼和輸出，從而使讀者更容易理解？ 我知道他們可以從github提取我所做的更改，並在本地計算機上查看它們。 但是考慮到每個人的時間限制，我仍然想知道是否有一種方法可以在github上的自述文件中同時顯示Rcode和輸出。

謝謝

Answer 1

在markdown中，對內聯代碼使用``，對代碼塊（多行）使用``````

Answer 2

GitHub只是一台服務器，它無法處理您的Rmarkdown文件。 兩種策略是：

1. 調用您的文件README.Rmd ，並在其上運行render()以生成一個包含輸出的README.md文件，並將兩者都推送到GitHub。
2. 設置像Travis-CI這樣的持續集成服務，並指示其呈現自述文件並將結果推回到GitHub。

從技術設置的角度來看，第一個選項是最簡單的-您只需要render() 。

第二個選項更方便，但是需要在倉庫中進行一些設置，配置Travis進行構建（但不能基於自己的提交），並在Travis上設置憑據以將其推回GitHub。 為此，您需要一個看起來像如下的.travis.yml文件：

language: r
script:
  - bash renderreadme.sh

在您的存儲庫中有一個bash腳本文件，名為renderreadme.sh ：

#!/bin/bash
set -o errexit -o nounset
renderreadme(){
  ## Set up Repo parameters
  git init
  git config user.name "your_github_username"
  git config user.email "your_email@example.com"
  git config --global push.default simple

  ## Get drat repo
  git remote add upstream "https://$GH_TOKEN@github.com/$TRAVIS_REPO_SLUG.git"
  git fetch upstream
  git checkout master

  Rscript -e 'rmarkdown::render("README.Rmd")'

  git add README.md
  git commit -m "knit README [skip ci]"
  git push
}
renderreadme

而且，您將需要使用travis客戶端 （或類似的客戶端 ）來存儲git push操作成功所需的安全GitHub憑據。 Travis的“構建R項目”中的常規指南對於這些常規配置方面將很有用。