R corrplot - 顏色依賴於值

Question

我有一個二進制data.fram e（53115 行；520 列），我想繪制一個相關圖。 我想根據值對其進行着色，相關值 >=0.95（紅色），否則為藍色。

correl <- abs(round(cor(bin_mat), 2))

pdf("corrplot.pdf", width = 200, height = 200)
a <- corrplot(correl, order = "hclust", addCoef.col = "black", number.cex=0.8, cl.lim = c(0,1), col=c(rep("deepskyblue",19) ,"red"))
dev.off()

我得到了相關圖，但在很多情況下我得到了錯誤的着色（見下文 0.91）。

數據： 文件

我怎樣才能擁有正確的着色？

Answer 1

一般來說， corrplot庫在涉及cl.lim和顏色時非常奇怪。 出於某種原因，是否設置cl.lim似乎並不重要 - 顏色仍會從 -1 分布到 1。

因此，在您的情況下，只需使用 39 種藍色而不是 19 種（以涵蓋從 -1 到 1 的范圍）：

cors <- cor(iris[,-5])
cors[cbind(c(1,2), c(2,1))] <- 0.912
corrplot(cors, col=c(rep("blue", 39), "red"), cl.lim=c(-1,1), addCoef.col="black")

結果：