如何在Python中解析PDB文件？

Question

我想創建一個可以從任何PDB文件中解析以下內容的函數：

1. 每個螺旋的螺旋ID和長度

2. sheetID，股數和殘基總數

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f=open('5ogb.pdb')
lines=f.readlines()

print lines[337] 
print lines[338]

print "helixID= AA2"

請問如何改善此代碼？ 提前致謝。

Answer 1

有很多不同的軟件包可以做到這一點。 我將使用biopython中的Bio.PDB模塊。 這是一個可以幫助您入門的教程 。