我的prop.test函數中每個單獨測試的p.value是多少？

Question

prop.test函數中每個單獨測試的p值是多少？ （見下面的代碼）。

當進行多次測試（在這種情況下k = 10000次測試）時，我想在prop.test中找到每個單獨測試的alpha，因為它顯然不是0.05。 函數prop.test必須以某種方式調整p值。

在互聯網和R中閱讀（在控制台中鍵入prop.test）時，我沒有找到p值是什么以及如何獲得它的答案。 我意識到在控制台中鍵入prop.test可以提供幫助，但我嘗試了它並且無法理解prop.test-code，足以理解alpha（對於單個測試）是什么。 因此，如果有人可以解釋我如何獲得alpha（個別測試）的數字，我將不勝感激。

非常感謝，/ Pedram

k <- 10000

pH0 <- 1:k
pH1 <- 1:k
nA <- 4000
nB <- 4000
p0 <- 0.01
p1 <- 2*p0

a = 0.05
pD = a

for(i in 1:k)
{
      x1 <- rbinom(1,nA,p0)
      x2 <- rbinom(1,nB,p0)
      y <- rbinom(1,nA,p1)

      pH0[i] <- prop.test(c(x1,x2),c(nA,nB))$p.value < pD
      pH1[i] <-prop.test(c(x1,y),c(nA,nA))$p.value < pD 
}
print(paste("FDR =",sum(pH0)/sum(pH0+pH1)))
print(paste("True positives =",sum(pH1)/k))
print(paste("FWER =",(1-((1-pD)^k)))

Answer 1

除非您將conf.level指定為0.95以外的conf.level ，否則alpha級別默認為0.5：

prop.test(x, n, p = NULL,
          alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
          conf.level = 0.95, correct = TRUE)

conf.level與1-alpha相同。 上面的代碼塊來自RStudio幫助菜單。