在閃亮的flexdashboard上加載RBioFormats時出錯

Question

我有一個使用flexdashboard的閃亮應用程序，我想繼續前一段時間開始的開發過程。

這個應用程序使用Bioconductor的RBioFormats包，現在我無法啟動我的應用程序。 在一些試驗之后，當啟動具有光澤的flexdashboard時會發生這種情況。 這次崩潰的責任來自於嘗試在flexdashboard-shiny app上加載RBioFormats庫。

另一方面，在純閃亮的應用程序（沒有flexdashboard），或純Flexdashboard非閃亮，應用程序正確運行。 我在其他腳本中使用RBioFormats，它也能正常工作。

這里我發布一個簡單的崩潰示例：

---
title: "Untitled"
output: flexdashboard::flex_dashboard
runtime: shiny
---

```{r setup, include=FALSE}
library(flexdashboard)
library(RBioFormats)
```

Column
-----------------------------------------------------------------------

### Chart A

```{r}

```

這個，拋出這個錯誤：

會話信息：

R version 3.5.3 (2019-03-11)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Arch Linux

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/libblas.so.3.8.0
LAPACK: /usr/lib/liblapack.so.3.8.0

locale:
 [1] LC_CTYPE=es_ES.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=es_ES.UTF-8       
 [4] LC_COLLATE=es_ES.UTF-8     LC_MONETARY=es_ES.UTF-8    LC_MESSAGES=es_ES.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=es_ES.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=es_ES.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] compiler_3.5.3        htmltools_0.3.6       tools_3.5.3           flexdashboard_0.5.1.1
 [5] yaml_2.2.0            Rcpp_1.0.1            rmarkdown_1.12        knitr_1.22           
 [9] jsonlite_1.6          xfun_0.6              digest_0.6.18         evaluate_0.13        
>

Answer 1

將Java Runtime Envrironment從v11降級到v8解決了這個問題。 Java v10產生了同樣的崩潰