在 WSL 上安裝 R devtools 包

Question

問題：

我正在嘗試為 R 安裝devtools包。我在WSL （Linux 的 Windows 子系統）上使用 Ubuntu 18.04 LTS。

我可以通過在 WSL 上的 R 中簡單調用install.packages()來安裝一些軟件包。 但是，其他軟件包似乎給我帶來了麻煩。

我嘗試過的以下方法似乎都不起作用：
* 我試過用install.packages()安裝包。
* 我試過從源安裝到/usr/local/lib/R/site-library 。
* 我試過從源代碼安裝到個人庫中。

錯誤信息：

我收到了一條類似此處討論的錯誤消息，但我無法通過編輯unpackPkgZip來解決該問題，因為它不存在。

問題：

如何在 WSL 上安裝 devtools？

Answer 1

解決方案：

我能夠通過重新開始解決問題。 我卸載了 Ubuntu，然后重新安裝了它。 通過全新安裝的 Ubuntu 18.04，我遵循了這些說明。 還有其他在線教程可能工作得很好，但我遵循了這個。 如果您願意，您可以忽略有關安裝 rstudio 服務器和 fsl 包的部分。

# Install R on WSL
sudo apt-get update -qq -y
sudo apt-get install -y wget git
OS_DISTRIBUTION=$(lsb_release -cs)
wget -O- http://neuro.debian.net/lists/${OS_DISTRIBUTION}.us-nh.full | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pool.sks-keyservers.net:80 0xA5D32F012649A5A9
sudo apt-get update

sudo apt-get install libopenblas-base r-base
sudo apt-get update -qq -y
sudo apt-get install -y libgit2-dev 
sudo apt-get install -y libcurl4-openssl-dev libssl-dev
sudo apt-get install -y zlib1g-dev libssh2-1-dev libpq-dev libxml2-dev 
#sudo apt-get install -y libhdf5 # This didn't work.

現在嘗試在 R 中安裝 devtools。

# Install devtools
install.packages("devtools", repos = "https://cran.rstudio.com/")

權限錯誤：

如果您遇到如下權限錯誤...

install.packages("edgeR") 中的警告：'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' 不可寫 您想改用個人庫嗎？ (是/否)

...您需要為用戶提供對安裝 R 包的目錄的寫訪問權限（請參閱此處）。 嘗試更改此目錄的組所有權：

# Who has ownership of /usr/local/lib/R/site-library/?
ls -l /usr/local/lib/R/
# drwxrwsr-x 1 root staff 512 Jul 18 21:38 site-library

# Change ownership.
sudo chgrp twesleyb /usr/local/lib/R/site-library/
ls -l /usr/local/lib/R/
#drwxrwxr-x 1 root twesleyb 512 Jul 18 21:38 site-library

# In this case I have write access, but in case you need to add it, try:
# $ sudo chmod g+w /usr/local/lib/R/site-library

您現在應該能夠install.packages("package") 。

我是 linux 新手，但我認為這是一件可以做的事情。

更新：

您也可以嘗試按照duckmayr 的說明進行操作。