無法在 docker 容器的 crontab 中運行 R 腳本

Question

我正在嘗試在 docker 容器內運行 R 腳本。 這是示例。

我的工作目錄如下所示。

myRDocker
  -dockerfile
  -scripts
     -save_iris.R

在myRDocker目錄中，有一個dockerfile和一個目錄scripts ，其中包含一個 R 腳本save_iris.R

我的 R 腳本save_iris.R如下所示：

write.csv(iris, '/data/iris.csv')

我的 dockerfile 如下所示：

# Install R version 3.6
FROM r-base:3.6.0

#install crontab
RUN apt-get update && apt-get -y install cron

RUN mkdir /data
COPY /scripts  /scripts

我去了我的目錄myRDocker並構建 docker 圖像

docker build -t baser .

我在 bash 中運行 docker 容器。

docker run -it baser bash

進入容器后，我做了：

crontab -e

然后添加這一行，然后保存

* * * * * Rscript /scripts/save_iris.R

它應該每分鍾將文件保存到文件夾/data中。 但是，我從未在容器內的數據文件夾中找到任何文件。

我的問題是：

1. 我在上述過程中做錯了什么？ 我覺得我可能錯過了一些東西......但無法弄清楚為什么......

2. 如果我想在容器啟動時運行計划的 cron 任務該怎么辦。 （類似於將 cron 任務放在一個文件中，並在容器啟動時運行......）

Answer 1

為什么您不在容器運行時啟動 cronjob，而不是在容器啟動后運行？ 另外，我認為 crontab 進程不會在您的情況下運行，因為您的容器沒有做任何事情。

試試這個，它將在容器運行時啟動cron ，並且還會跟蹤 cron 作業的日志。 但請記住，在這種情況下，您的主要進程是tail -f /var/log/cron.log而不是 cron 進程。

 FROM r-base:3.6.0

 RUN apt-get update &&  apt-get -y install cron

 RUN touch /var/log/cron.log
 COPY hello.r /hello.r
 RUN (crontab -l ; echo "* * * * * Rscript /hello.r  >> /var/log/cron.log") | crontab

# Run the command on container startup
 CMD cron && tail -f /var/log/cron.log

因此，您將獲得 Rscript 控制台日志到 Container 標准輸出。

你好。r

print("Hello World from R")