如何使用 Python 根據日期和術語從 Pubmed 中檢索信息？

Question

你能告訴我如何從PubMed獲取 5 篇包含“肥胖”一詞的最新文章，並使用 Python 返回每篇論文的作者、標題、日期、doi 和 PubMed PMID？ 先感謝您

編輯：

我的嘗試到目前為止。 我相信這是想要的結果，但我需要獲得正確的 pubmed id 才能運行該函數

from Bio.Entrez import efetch
from Bio import Entrez
Entrez.email = 'name@example.com'

def print_abstract(pmid):
    handle = efetch(db='pubmed', id=pmid, retmode='text', rettype='abstract')
    print(handle.read())

print_abstract(pmid)

Answer 1

您可以使用esearch從功能Bio.Entrez找到匹配的查詢最近的考研條目的UID：

handle = Entrez.esearch(db="pubmed", term="obesity", retmax=5)
results = Entrez.read(handle)                                                   
print(results["IdList"])

通過指定term ，您可以提供一個查詢字符串 - 從您的問題中，您正在尋找與“肥胖”相關的條目。 retmax允許我們配置應該返回多少個 UID（默認為 20）。

當我現在運行它時，我得到以下 UID：

['32171135', '32171042', '32170999', '32170940', '32170929']

在撰寫本文時，這些對應於您手動執行 PubMed 搜索時的最新條目 UID。 它們按最近的條目排序。

使用這些 UID，您的print_abstract函數將按預期執行。