通訊指令問題

Question

我正在嘗試比較兩個基因列表並提取常見的。 我對 my.txt 文件進行了排序並使用了 comm 命令：

通訊基因_list1.txt 基因_list2.txt

奇怪的是，我查output的時候，有很多共同基因沒有印在第三行。 這是 output 的一部分：

如您所見，兩個文件中都存在AAAS和AAGAB等，但它們沒有打印為公共行？ 知道為什么會這樣嗎？

謝謝

Answer 1

$ comm file1.txt file2.txt

上述命令的 output 包含三列，其中第一列由零制表符分隔，並且包含僅存在於 file1.txt 中的名稱。

第二列包含僅存在於 file2.txt 中並由一個制表符分隔的名稱。

第三列包含兩個文件共有的名稱，並由行首的兩個制表符分隔。

這是不使用選項時 comm 命令產生的 output 的默認模式。

我假設，兩個輸入文件都按排序順序。 那么您的用例所需的命令將是

$ comm -12 gene_list1.txt gene_list2.txt

這意味着列（1 和 2）都被抑制（不顯示）。 因為您只對兩個文件共有的元素感興趣。