python 腳本在 1 分鍾后停止在終端上運行

Question

我的 python 腳本遇到問題。 我在我的機器上使用 Ubuntu 作為第二個操作系統，我已經編寫了 python 代碼到 output 關於某些蛋白質的不同信息。 在給我輸出第一個蛋白質之后，它在第二個蛋白質的過程中間減慢了很多，並且在某些時候它不會再響應了。 當我鍵入 control+c 時，我收到以下消息：

Traceback (most recent call last):
File "testPerf.py", line 185, in <module>
uniqueDict(args.input,args.output)

File "testPerf.py", line 73, in uniqueDict

keyName = '%s_%s' %(hmm[i],cassetteId[i])

File "/home/t/anaconda3/envs/crispr-env/lib/python3.7/site-packages/pandas/core/series.py",
line 1071, in __getitem__

result = self.index.get_value(self, key)

File "/home/t/anaconda3/envs/crispr-env/lib/python3.7/site-packages/pandas/core/indexes>>/base.py", line 4708, in get_value

s = getattr(series, "_values", series)

File "/home/t/anaconda3/envs/crispr-env/lib/python3.7/site-packages/pandas/core/series.py", line 562, in _values

它停止時的代碼部分如下：

 with open(crisprOutputFile, "r") as file1:
            data = pd.read_csv(file1)
            hmm  = data.HMM
            cassetteId = data.cassette_id
            list1 = data.predicted_label
            i = 0
            while i < len(hmm):
                predictedL = list1[i][7:20]
                predictedL =  predictedL.replace( ')','')
                predictedL =  predictedL.replace( ']','')
                predictedL =  predictedL.replace( "'","")
                predictedL =  predictedL.replace( ',','')
                keyName = '%s_%s' %(hmm[i],cassetteId[i])
                if keyName not in dict1:
                    dict1[keyName] = predictedL
                    i+=1

這是一段代碼，從一個名為 KrisprOutputFile 的文件中讀取內容，並嘗試 output 字典中的一些數據，這很容易......之后，這個字典與其他一些字典結合，給出了 output 字典，其中包含有關蛋白質的數據。 請幫忙。

Answer 1

在給定的代碼片段中，如果在dict1中找到keyName ，則i不會遞增。 如果i保持不變，則當前迭代將與上一次迭代相同，因此它將成為無限循環。

如果您實際上打算在每次迭代時更新i （這更有意義），請像這樣降低i+=1的集成級別

with open(crisprOutputFile, "r") as file1:
            data = pd.read_csv(file1)
            hmm  = data.HMM
            cassetteId = data.cassette_id
            list1 = data.predicted_label
            i = 0
            while i < len(hmm):
                predictedL = list1[i][7:20]
                predictedL =  predictedL.replace( ')','')
                predictedL =  predictedL.replace( ']','')
                predictedL =  predictedL.replace( "'","")
                predictedL =  predictedL.replace( ',','')
                keyName = '%s_%s' %(hmm[i],cassetteId[i])
                if keyName not in dict1:
                    dict1[keyName] = predictedL
                i+=1

正如評論中@run-out 所建議的那樣，我建議您使用for循環。