如何通過python3將多個png或Jpeg圖像轉換為一個nifti圖像？

Question

我有 191 個不同的 png 圖像。

如何將它們轉換為一張 3d nifti 圖像？

Answer 1

這是一個 SimpleITK python 腳本，它可以讀取一堆 PNG 圖像和 output 一個 3d Nifti 圖像：

import SimpleITK as sitk
import glob

file_names = glob.glob('*.png')
reader = sitk.ImageSeriesReader()
reader.SetFileNames(file_names)
vol = reader.Execute()
sitk.WriteImage(vol, 'volume.nii.gz')

該腳本假定glob以正確的順序獲取文件名。 此外，創建的 3-d 體積將在 X、Y 和 Z 中具有統一的間距。如果 Z 間距與 X 和 Y 不同，您可以使用任何間距值調用vol.SetSpacing 。