pdp plotPartial 無法更改 zlim

Question

我正在 R 中為隨機森林繪制一些部分依賴圖。 我正在使用 pdp 包，它沒有對我在 z 變量中的限制的任何規范做出反應。 代碼：

pd <- partial(RF, pred.var= c ( "SOC", "Q"))
plotPartial(pd, zlim=c(1000,3000))

我也試過：zlim(c(1000,3000), and zmax and min and similars

Answer 1

感謝您的建議，這是我的代碼

library(randomForest) #fitting RF
library(pdp) #partial dependence analysis

set.seed(100)
RF=randomForest(CorrYield~Year+SOC+pH+ Sorghum+Pbray + FertP+ FertN+ PP_veg +PP_PC, data= RF_sin1 , ntree=500, importance=T, proximity=T)

pd_SOC_P <- partial(RF, pred.var= c("SOC", "Pbray"))
plotPartial(pd_SOC_P,xlab="SOC(%)", ylab="PBray(mg kg^-1)")